前往小程序,Get更优阅读体验!
立即前往
首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布
社区首页 >专栏 >关于F统计量的澄清

关于F统计量的澄清

作者头像
生信与临床
发布2022-08-21 17:39:14
2.1K0
发布2022-08-21 17:39:14
举报

在孟德尔随机化研究中,弱工具变量偏倚(weak instrument bias)是需要我们认真对待的一个问题,它通常是因为样本量较小导致的。在往期推送中,米老鼠和大家介绍过评价弱工具变量偏倚的策略------孟德尔随机化之F统计量。一般而言,当F 统计量大于经验值10时,我们认为工具变量法估计值的偏倚大约是观察性研究的10%,因此F大于10这个标准在孟德尔随机化研究中广为使用。然而,这样的盲目使用不见得是合理的。

早在2011年,Stephen Burgess等学者就提出盲目且单一使用F统计量大于10来判断弱工具变量偏倚是不合理,为此他们利用哥本哈根队列(Copenhagen General Population Study,CGPS) 去探索C反应蛋白对纤维蛋白原的影响,他们将总人群分别平均分成5,10,16,40,100和250个子队列,然后将子队列的结果进行meta分析,具体结果如下表:

以第三行数据为例,它表示将总人群等分为10个子队列,对每个子队列进行观察性估计(observational estimate),两阶段最小二乘法工具变量估计(two stage least squares instrumental variable estimate)和有限信息的极大似然估计(limited information maximum likelihood instrumental variable estimate),然后计算着10个子队列的平均F统计量。从上表中我们不难看出,随着均分的子队列数目增加,观察性估计量比较稳定,2SLS和LIML的估计值和实际观察值越来越接近,但是每个子队列的平均F统计量在不断减少。也即说明,等分的子队列数目越多,工具变量估计值越接近真实值,但这时候F统计量可能是比较小的。

从上表中我们不难看出单纯依靠F统计量大于10来判断弱工具变量偏倚是不可靠的,当然我们这里并不是否认F统计量的作用,在实际研究中,F统计量越大,确实偏倚会小,但不能拿F大于10作为“金标准”。

目前来看,我们可以将F统计量和meta分析方法有效结合来避免这样的偏倚。这里的meta分析是指针对个体数据分成子样本后meta或者针对汇总数据将不同研究的遗传效应进行meta分析。

参考文献:

  1. Burgess S, Thompson SG; CRP CHDGenetics Collaboration. Avoiding bias from weak instruments in Mendelianrandomization studies. IntJ Epidemiol. 2011 Jun;40(3):755-64. doi: 10.1093/ije/dyr036. Epub 2011 Mar 16.PMID: 21414999.
本文参与 腾讯云自媒体分享计划,分享自微信公众号。
原始发表:2022-01-18,如有侵权请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除

本文分享自 生信与临床 微信公众号,前往查看

如有侵权,请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除。

本文参与 腾讯云自媒体分享计划  ,欢迎热爱写作的你一起参与!

评论
登录后参与评论
0 条评论
热度
最新
推荐阅读
领券
问题归档专栏文章快讯文章归档关键词归档开发者手册归档开发者手册 Section 归档