2021年1-2月ceRNA研究汇总

已知microRNA可以通过结合mRNA导致基因沉默，而ceRNA可以通过竞争性地结合microRNA来调节基因表达。ceRNA可以通过应答元件（microRNA response elements，MREs)与microRNA结合从而影响microRNA导致的基因沉默。如：miRNA可通过抑制目的基因mRNA的翻译，或促进mRNA降解来起到负调控的作用，而另一些RNA，如circRNA，能够像海绵一样吸收、结合miRNA，使其不能发挥负调控的作用，从而促进靶基因的表达。

ceRNA机制示意图

ceRNA调控机制近年来一直是研究热点，2021年1月~2月PubMed上可检索到的文章就有375篇，其中超过5分的文章小编已经为大家整理好啦，详细信息见文末附表，让您不用再费时费力搜索，就能轻松获取最新的ceRNA机制研究成果和动态。小编挑出以下5篇作为重点分享内容。

文章展示

标题：环状RNA circSDHC充当miR-127-3p的海绵，通过CDKN3/ E2F1轴促进肾细胞癌的增殖和转移

期刊：Mol Cancer.

影响因子：15.302

发表时间：2021.01.20

单位：中山大学附属第一医院

摘要：越来越多的证据表明，环状RNA（circRNA）在癌症的发生和发展中起着重要的调节作用。但是circRNA在肾细胞癌（RCC）中的表达模式和生物学功能尚不清楚。该研究利用生物信息学方法筛选在RCC中差异表达的circRNA，在线circRNAs芯片数据集和研究者自己的患者队列的分析表明，circSDHC（hsa_circ_0015004）在RCC中具有潜在的致癌作用。通过qPCR测量RCC组织和细胞系中的circSDHC表达，并评估circSDHC的预后价值；此外进行了一系列功能性体外和体内实验，以评估circSDHC对RCC增殖和转移的影响。RNA pull-down测定，荧光素酶报告基因和荧光原位杂交测定确认circSDHC，miR-127-3p及其靶基因之间的相互作用。研究结果显示：临床上，circSDHC的高表达与RCC患者的TNM分期晚期和生存不良有关。此外，circSDHC在体内和体外均促进肿瘤细胞的增殖和侵袭，对circSDHC在RCC中作用的潜在机制的分析表明，它与miR-127-3p竞争性结合并阻止其抑制下游基因CDKN3和E2F1途径，从而导致RCC恶性进展。敲低circSDHC会导致CDKN3表达降低和E2F1途径抑制，这可以通过用miR-127-3p抑制剂来挽救。该研究数据首次表明circSDHC/ miR-127-3p/ CDKN3/ E2F1轴在RCC进展中起着至关重要的作用，因此circSDHC有望成为RCC患者的新治疗靶点。

标题：三阴性乳腺癌中CircNR3C2通过海绵化miR-513a-3p促进HRD1介导的肿瘤抑制作用

期刊：Mol Cancer.

影响因子：15.302

发表时间：2021.02.02

单位：南京医科大学附属逸夫医院

摘要：E3泛素连接酶HRD1在乳腺癌中被下调并起抑癌作用，而HRD1在不同乳腺癌亚型中的确切表达特征仍然未知。最近的研究表征了环状RNA（circRNA）在肿瘤进展中起miRNA海绵的调控作用，为癌症相关基因的转录后调控提出了新观点。该研究使用公共芯片/ RNA测序数据集和乳腺癌组织/细胞系检测HRD1蛋白和mRNA的表达。基于公共RNA测序结果，在线数据库和富集/聚类分析预测可能调节HRD1表达的circRNA/miRNA的关系对。体内和体外的功能获得性和挽救实验，评估circNR3C2通过HRD1介导的波形蛋白蛋白酶体降解对乳腺癌进展的抑制作用。HRD1在三阴性乳腺癌（TNBC）中相对于其他亚型而言明显低表达，并且与波形蛋白呈负相关，通过诱导多聚泛素化作用抑制乳腺癌细胞的增殖、迁移、侵袭和EMT（上皮间质转化）过程，介导的波形蛋白的蛋白酶体降解。在TNBC中，CircNR3C2（hsa_circ_0071127）也显著下调，与浸润性乳腺癌的远处转移和致死率负相关。通过在海绵吸附体内表达miR-513a-3p，在体外和体内过表达circNR3C2会增强HRD1的肿瘤抑制作用。该研究阐明了circNR3C2/miR-513a-3p/HRD1/Vimentin轴负调节TNBC转移，表明circNR3C2和HRD1可以作为潜在的预后生物标志物，可促进针对侵袭性乳腺癌患者的circNR3C2和HRD1的治疗剂的开发。

标题：circEHBP1通过miR-130a-3p /TGFβR1/ VEGF-D信号传导促进膀胱癌的淋巴管生成和淋巴转移

期刊：Mol Ther.

影响因子：8.986

发表时间：2021.02.03

单位：中山大学孙逸仙纪念医院

摘要：淋巴转移是膀胱癌复发和死亡的主要原因。越来越多的证据表明，淋巴管生成是触发淋巴转移所必不可少的。但是，具体机制了解甚少。本研究揭示了一种参与膀胱癌淋巴转移的途径，其中环状RNA（circRNA）以独立于血管内皮生长因子C（VEGF-C）的方式促进淋巴管生成。新型circRNA circEHBP1在膀胱癌中显著上调，与淋巴结转移和膀胱癌患者预后不良呈正相关。CircEHBP1通过与miR-130a-3p结合并拮抗miR-130a-3p对TGFBR1的3'UTR区的抑制作用，上调了转化生长因子β受体1（TGFBR1）的表达。随后，circEHBP1介导的TGFβR1过表达激活了TGF-β/ SMAD3信号通路，从而促进了VEGF-D的分泌并驱动膀胱癌的淋巴管生成和淋巴转移。重要的是，体内施用VEGF-D中和抗体可显著阻断circEHBP1诱导的淋巴管生成和淋巴转移。研究结果表明，circEHBP1/miR-130a-3p /TGFβR1/ VEGF-D轴有助于膀胱癌的淋巴管生成和淋巴转移，而与VEGF-C无关，表明circEHBP1可用于膀胱癌淋巴转移的潜在的生物标志物和治疗靶标。

标题：MSC诱导的lncRNA AGAP2-AS1通过调节乳腺癌中的CPT1表达和脂肪酸氧化来促进干性和曲妥珠单抗抗性

期刊：Oncogene

影响因子：7.971

发表时间：2021.01

单位：海南医科大学附属医院

摘要：曲妥珠单抗耐药性已成为治疗HER-2阳性乳腺癌患者的主要障碍，越来越多的证据表明，间充质干细胞(mesenchymal stem cells, MSCs)在耐药形成过程中发挥重要作用，但其作用机制尚不清楚；研究通过质谱、RNA pull down和RNA免疫沉淀等方法验证AGAP2-AS与其他相关靶标(human antigen R (HuR)、miR-15a-5p、carnitine palmitoyl transferase 1 (CPT1))之间的直接相互作用。进行体外和体内实验测定以阐明AGAP2-AS1在曲妥珠单抗抗性，干性和脂肪酸氧化（FAO）中的功能作用。结果显示间充质干细胞共培养可诱导曲妥珠单抗耐药性。在msc培养的细胞中，AGAP2-AS1表达上调，而AGAP2-AS1的下调逆转了msc介导的曲妥珠单抗耐药性。MSC培养诱导的AGAP2-AS1通过激活FAO调节干性和曲妥珠单抗抗性。从机制上讲，AGAP2-AS1与HuR相关，且AGAP2-AS1 - HuR复合物可直接与CPT1结合，通过提高RNA稳定性增加其表达。此外，AGAP2-AS1可通过海绵作用miR- 15a-5p释放CPT1 mRNA，发挥ceRNA的作用；临床上，血清AGAP2-AS1表达升高预示乳腺癌患者对曲妥珠单抗治疗反应不良。综上所述，MSC培养诱导的AGAP2-AS1通过促进CPT1表达和诱导FAO引起干性和曲妥珠单抗抗性。研究结果为MSCs在曲妥珠单抗耐药中的作用提供了新的思路，而AGAP2-AS1可能成为HER-2+乳腺癌患者的预测生物标志物和治疗靶点。

标题：脐带间充质干细胞来源的外泌体lncRNA H19通过miR-29b-3p/FoxO3轴提高骨软骨活性

期刊：Oncogene

影响因子：7.919

发表时间：2021.01

单位：同济大学医学院附属上海市第十人民医院

摘要：前期研究发现，来自脐带间充质干细胞(UMSCs)的外泌体lncRNA H19在骨软骨再生中发挥着关键作用，在本研究中，研究了外泌体lncRNA H19是否可以作为竞争性内源性RNA (ceRNA)增强软骨细胞中的骨软骨活性。通过双荧光素酶报告基因检测、RNA pull-down、RNA免疫沉淀(RIP)和荧光原位杂交(FISH)验证miR-29b-3p与lncRNA H19和靶mRNA FoxO3之间的相互作用。软骨细胞用lncRNA H19高表达的umsc来源的外泌体处理，然后进行凋亡、迁移、衰老和基质分泌评估，通过SD大鼠软骨缺损体内模型，探讨lncRNA H19/miR-29b-3p的作用及机制。外泌体显示出将lncRNA H19转移到软骨细胞的能力，从机制上讲，外泌体lncRNA H19作为miR-29b-3p竞争的内源性海绵增强了骨软骨活性，而miR-29b-3p直接靶向FoxO3。关节内注射过表达lncRNA H19的外泌体可促进持续软骨修复;然而，miR-29b-3p agomir可能会削弱这一作用。研究揭示了过表达lncRNA H19的umsc来源的外泌体在制定对抗软骨缺损机制方面的重要作用，研究发现，外泌体H19在体内和体外均能促进软骨细胞迁移、基质分泌、凋亡抑制和衰老抑制。其具体机制是外泌体H19作为ceRNA对抗miR-29b-3p，上调软骨细胞中的FoxO3。

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