基因家族分析终极版之R语言版

❝好些年之前写过基因家族分析的文档，今年恰逢有朋友有这方面的需求于是小编重新整理了一下「基因家族分析的图表」,以往大家均是使用软件来进行基因家族的数据分析及可视化，随着小编代码水平的提高这次所展示的所有图表均由「ggplot2」及其扩展包组合完成，通过这种方式做的基因家族文章可以完全称得上生物信息，当然本教程的重点已经不再是基因家族分析了，而是深入的使用R语言来进行数据分析，关于「教程后续会出介绍内容，尽情期待」,下面来放部分结果给大家参考

❝基因家族类的文章主要以短平快为主，且不耗费经费实在物美价廉，但目前的基因家族文章基本与生信关联不大，主要依靠图形软件来进行完成，不利于学习者后期的深入发展；小编所展示的结果图均由R完成，基因家族分析主要包括motif分析，pfam分析，基因结构分析，染色体定位，基因表达量分析，ka/ks，多物种进化树，多物种间共线性分析，单物种间共线性分析，顺势作用元件及qPCR，上述内容可融合为10张图进行展示 ❞

Figure-1(motif)

Figure-2(保守结构域与基因结构图)

Figure-3(多物种进化树)

Figure-4(顺势作用元件图)

Figure-5(热图)

这里使用了之前的一份经典热图来进行展示

Figure-6(GO富集分析)

Figure-7(染色体定位及kegg通路)

❝此图若是做「人或小鼠」将更加富有潜力，若有观众老爷手里有合适的数据并对此图感兴趣，可以与我联系 ❞

Figure-8(qPCR)

由于手里没有合适的qPCR数据这里用了之前的一组图来进行替代，绘图原理是一致的

Figure-9

❝多物种间共线性分析，单物种间共线性分析；这部分等有空了再进行整理 ❞