前往小程序,Get更优阅读体验!
立即前往
首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布
社区首页 >专栏 >人肺内皮细胞整合单细胞图谱

人肺内皮细胞整合单细胞图谱

作者头像
生信菜鸟团
发布2022-10-31 17:40:41
2980
发布2022-10-31 17:40:41
举报
文章被收录于专栏:生信菜鸟团生信菜鸟团

推荐一篇单细胞转录组测序对人肺内皮细胞进行详细解析的文献。

文献:Integrated Single-Cell Atlas of Endothelial Cells of the Human Lung. Circulation. 2021.doi: 10.1161/CIRCULATIONAHA.120.052318.

背景:肺内皮细胞的多样性在人类中尚未得到系统的描述。我们提供了人类肺内皮细胞(ECs)的参考图谱,以促进更好地理解肺内皮细胞的表型多样性和组成。

结果:6个肺scRNAseq数据集被重新分析和注释,以识别来自73个个体的15000个血管EC细胞。EC的差异表达分析显示了与内皮谱系相关的特征,包括泛内皮、泛血管和亚人群特异性标记基因集。除了淋巴、毛细血管、动脉和静脉内皮细胞的宽泛细胞类别外,还在静脉EC中发现了以前难以区分的亚群,分别为定位于肺实质的肺静脉EC (COL15A1neg)和定位于气道和肺胸膜的全身静脉EC (COL15A1pos)。在毛细血管EC中,我们确认了它们的亚分类为最近发现的以EDNRB、SOSTDC1和TBX2为特征的空化细胞和一般毛细血管EC。

文章附有一个在线数据挖掘工具(www.LungEndothelialCellAtlas.com)。

结论:作者综合分析提供了一个全面和精心制作的正常肺内皮细胞参考图谱,并确认和详细描述了大量人类和小鼠中此前未被识别的内皮细胞群。

本文参与 腾讯云自媒体分享计划,分享自微信公众号。
原始发表:2022-10-06,如有侵权请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除

本文分享自 生信菜鸟团 微信公众号,前往查看

如有侵权,请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除。

本文参与 腾讯云自媒体分享计划  ,欢迎热爱写作的你一起参与!

评论
登录后参与评论
0 条评论
热度
最新
推荐阅读
领券
问题归档专栏文章快讯文章归档关键词归档开发者手册归档开发者手册 Section 归档