读《糖生物学基础》

跟着运来兄搭建自己的生物信息小书房。趁年轻，读几本硬书，到老了慢慢反刍。

我们应该还记得高中生物课文中，科学家如何确定遗传物质是DNA而不是其他分子的著名生物学实验：肺炎双球菌转化实验。那个时候，糖，作为一类生物大分子也曾参与过“遗传物质”这一桂冠的竞逐。然而，如我们生物老师教的：遗传物质是DNA。并以此为核心建立了生物信息学。

就算时至今日，当人们提起生物信息，往往指的是：DNA -> RNA -> 蛋白质这样的信息流动管线及其之间的相互调控关系。当我们把镜头从细胞内的分子向后拉到细胞水平，不难发现，生物信息不应该只是描述细胞内信息的一门学科，随着单细胞技术的发展，细胞间的生物信息同样重要。细胞间的信号如何传导？细胞如何相互识别？到细胞这个单位上，还有两类分子值得我们注意：糖类和脂类。

糖类和脂类可以作为产能的中间体、信息分子或者结构组分，它们的加入，使得生物信息，或者生物信息所依附的中心法则进一步得到扩展。

糖生物学基础，瓦尔基等编著，张树政等翻译

得益于现代分子生物学的发展，我们对经典中心法则基本了然于胸，大致可窥探到细胞内生物信息的流向，这也是生物信息的经典定义。单细胞相关技术，包括但不限于单细胞测序技术的发展，细胞之间的生物信息学研究日渐凸显出来。这也是分子生物学与细胞生物学之间的一种技术侧重。生物信息学会不会从以DNA为核心转移到以细胞为核心，这一点我们无力推断，无疑的是：我们将以更大的维度来理解生物信息学。

糖类以及糖缀合物作为结构组分中的作用构建复杂多细胞器官和生物体中十分重要，因为在构建中，细胞之间以及细胞与其基质之间细胞相互作用。糖生物学也被描述为：后基因组研究的序曲。经典中心法则信息流是由模板驱动的，最大的魅力在于其模板的复刻确保信息的准确性。而糖生物学的规律似乎没有那么明显，这可能也是糖生物学被系统提出来较晚的原因之一。

糖生物学基础，瓦尔基等编著，张树政等翻译

2022年十月诺贝尔化学奖颁布，为我们送来点击化学与生物正交化学的新概念。诺奖得主之一Bertozzi的主要研究就是糖相关的生物学，曾说：我有一个想法：也许化学家会推动一场糖科学革命。与发现Siglec的糖免疫学家Paul Crocker共同创建了Palleon Pharmaceuticals公司，此后的五年之内，Bertozzi又创建了四家相关的公司。以聚糖为基础，这几家公司专注于从诊断到药物偶联技术。

在Bertozzi的一次演讲中，把细胞膜表面的糖比喻为“糖衣”，是非常形象的了。

诺奖得主卡罗琳在2016年的TED演讲

• 糖基化
• 糖免疫生物学
• 抗体糖基化与工程改造
• 细胞活化的糖基化改变
• 。。。

糖的世界好像一下子打开了，这里花团锦簇，蜜蜂紧锣密鼓在不同的花蕊里采着甜蜜蜜的蜜。

推荐一本2022年新出版的在NCBI Bookshelf上开源的糖生物学电子书：

上链接：

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK579927/

关注应用的话，可以重点关注这一章：

Glycans in Physiology and Disease

Publication Details

    39. Glycans in Glycoprotein Quality Control
    40. Free Glycans as Bioactive Molecules
    41. Glycans in Systemic Physiology
    42. Bacterial and Viral Infections
    43. Parasitic Infections
    44. Genetic Disorders of Glycan Degradation
    45. Congenital Disorders of Glycosylation
    46. Glycans in Acquired Human Diseases
    47. Glycosylation Changes in Cancer

https://mp.weixin.qq.com/s/MSWIYdsJPRZNR9TQS_fh4A

http://ibms.suda.edu.cn/3491/list.htm https://palleonpharma.com/

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK579927/

https://mp.weixin.qq.com/s/xDBADiPgHuPDrV3m2Qfl_A