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接收“生信分析+简单实验验证”套路文章!国人友好,发文量大!

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百味科研芝士
发布2022-12-12 16:05:40
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发布2022-12-12 16:05:40
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随着生信分析的热门程度与日俱增,生信分析类文章最近几年产出呈现井喷趋势,不少小伙伴们纷纷表示纯生信文章越来越难发了。事实上,有实验的生信会比完全纯的生信好发,哪怕你只补上一个简单的PCR验证或者免疫组化实验验证。这样简单实验需要经费少,即使没有国自然基金资助,市级课题或者校级课题的基金资助就足已完成验证。因此,小编将陆续给大家推荐几本“生信分析+简单实验验证” 且对国人极度友好的SCI期刊,供大家参考。首先就从PeerJ期刊开始介绍。

01

基本信息

英国生物学领域综合性期刊Peer J,创刊于2013年,2014年有第一个影响因子,由PEERJ INC出版商以月刊的形式进行出版。ISSN/eISSN号均为2167-8359。

官方网站主页为:https://peerj.com/

官方投稿网站为:https://peerj.com/login

02

JCR及中科院分区

JCR分区:近几年,Peer J杂志在综合性期刊中(MULTIDISCIPLINARY SCIENCES)稳定维持于Q2区,2020年,该期刊排列在该领域73本期刊中的第33位。

中科院分区:在2021年12月基础版中,Peer J位于生物学大类以及综合性期刊(MULTIDISCIPLINARY SCIENCES)小类领域中均列为3区,非Top期刊,非综述性期刊;而在2021年12月最新升级版中,Peer J大类和小类仍为3区。

03

接收领域

PeerJ作为一本综合性期刊,收录范围比较广泛,涉及生物科学,环境科学,医学和健康科学等方面的文章。PeerJ目前只接受论著和综述两种类型的文章,不接受观点、案例报道等类型的文章。

另外,该刊对于采用低通量的实验技术(采取试验对象是细胞,临床样本或者动物,技术方法也是简单的qRT-PCR或者IHC)去验证高通量的生信数据挖掘的结果的“生信分析+简单实验验证”套路文章也是接收的。例如:

2022年1月最新发表一篇“生信分析+简单实验验证”套路文章,题为:Bioinformatics analysis and identification of hub genes and immune-related molecular mechanisms in chronic myeloid leukemia,文章从GEO数据库中提取了基因芯片数据集GSE100026。生物信息学分析用于确定慢性髓系白血病患者和正常人外周血单核细胞(PBMC)的差异表达免疫相关基因。并利用功能富集和基因集富集分析(GSEA)探讨其潜在机制。Cytoscape软件中MCODE和CytoHubba插件筛选出差异表达免疫相关基因的核心基因,进一步采用qRT-PCR验证临床样本中枢纽基因的表达。

2022年3月也发表一篇采用类似套路发表的文章,题为:Identification of potential biomarkers of vascular calcification using bioinformatics analysis and validation in vivo。文章从GEO数据库中提取了与血管钙化(VC)有关的基因表达数据集GSE146638。生物信息学分析确定正常血管以及血管钙化血管的差异表达基因(DEGs),并筛选出影响血管钙化核心基因和关键通路。最后,通过定量逆转录PCR(RT-qPCR)和免疫组化(IHC)实验验证核心基因基因在正常和钙化血管组织中的表达,来进一步验证生信分析的准确性和可靠性。本论文的研究完善了血管钙化的分子调控机制,并确定了Spp1、Sost、Col1a1、Fn1和Ibsp可能是VC的潜在新型生物标志物和有前途的治疗靶点。

04

影响因子

PeerJ期刊近几年影响因子一直呈现上升趋势,2021年最新的影响因子突破3分,达3.061分。

05

历年发文量

在2015年以前,PeerJ期刊的年发文量都在1000篇以下。在2016年发文量有了较明显的突破,达到1298篇。此后几乎逐年扩增发文量,在2019年猛增到2125篇,2020年达到2285篇,2021年的发文量稍回降到2086篇,其中包括研究型论文(Article)2,038篇,综述性(Review)论文48篇。

06

审稿速度

有网友分享该刊的平均审稿速度为10 周,笔者也调研最近发表在该刊上的论文,发现该刊的文章从投稿到接收基本维持在2-3个月左右,但是接收到出版会有个把月的延迟,整体来说审稿速度还算快。

07

版面费

Peer J作为一本开放获取(OA)的期刊,可以以一次性付款获得PeerJ会员资格,并永久定期发布,无需额外费用。而对于出版一篇文章的版面费比同类期刊,譬如PLOS ONE, eLife等也稍便宜,目前官网显示Peer J的版面费是1395美元(人民币约10,000元)。

08

国人学者文章占比

经Web of Science检索分析,PeerJ杂志上近三年发表的文章中,国人学者的占比最高,多达2401篇。其次为美国学者,有1275篇,英国学者发文量排名第三,发文量为357篇。

从近三年统计的发文机构同样可以看出,PeerJ期刊对国人极度友好,发文量前九名中有三家机构都是来自于中国,分别是中国科学院(CHINESE ACADEMY OF SCIENCES)、中南大学(CENTRAL SOUTH UNIVERSITY CHINESE) 中国农业科学院(ACADEMY OF AGRICULTURAL SCIENCES)。

09

自引率

近几年Peer J期刊自引率维持在5%左右,2021-2022年度最新自引率为3.7%,这个比例远低于警戒线,无自引风险。

10

总结

根据81名科研工作者对该期刊的声誉、影响力、审稿速度进行评价,该刊综合评分为6.5分,声誉评分为6.9分,审稿速度评分高达8.3分,影响力方面分数稍微偏低。该期刊作为一本OA期刊,虽说在领域的影响力尚有待增强,但考虑其接收领域广泛,版面费适中,审稿速度较快,对国人极度友好等几个优势,也值得纳入小伙伴们的投稿清单,并且对于科研经费不充足,或者用于升职称的医学小伙伴们来说,性价比更是极高的。

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原始发表:2022-10-04,如有侵权请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除

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