设置好了conda镜像为什么仍然是有CondaHTTPError

生信技能树

发布于 2022-12-16 14:41:59

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发布于 2022-12-16 14:41:59

文章被收录于专栏：生信技能树

最近有学员使用我们的共享服务器，在里面安装好了conda之后，很简单的管理一个软件却遇到了报错，命令如下所示：

conda install  -y -c bioconda  trim-galore

报错如下所示：


Downloading and Extracting Packages
fastqc-0.11.9        | 9.7 MB    | ############################3                                                         |  33%

CondaHTTPError: HTTP 000 CONNECTION FAILED for url <https://conda.anaconda.org/bioconda/noarch/fastqc-0.11.9-hdfd78af_1.tar.bz2>
Elapsed: -

An HTTP error occurred when trying to retrieve this URL.
HTTP errors are often intermittent, and a simple retry will get you on your way.

学员非常肯定他是设置好了镜像：

conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --set show_channel_urls yes

而且也查看了他自己的 condarc ：

$ cat ~/.condarc
channels:
  - https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
  - https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
  - https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
  - https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
show_channel_urls: true

管理员让他简单的修改了前面的命令，就是删除 -c bioconda ，命令如下所示：