[Genome Biology | 论文简读] metaMIC：从头宏基因组组装的无参考错误组装识别和校正

简读分享 | 尹成林 编辑 | 李仲深

论文题目

metaMIC: reference-free misassembly identification and correction of de novo metagenomic assemblies

论文摘要

评估宏基因组组装的质量对于构建可靠的宏基因组组装基因组和下游分析非常重要。作者开发了 metaMIC (https://github.com/ZhaoXM-Lab/metaMIC)，这是一种基于机器学习的工具，用于识别和纠正宏基因组组装中的错误组装。模拟和真实数据集的基准测试结果表明，metaMIC 在识别错误组装的重叠群时优于现有工具。此外，metaMIC 能够定位错误组装断点，并且通过在错误组装断点处拆分来纠正错误组装可以改善下游任务。

论文链接

https://genomebiology.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13059-022-02810-y