生信技能树笔记day4

原创

天空UP

修改于 2023-01-16 17:09:15

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文章被收录于专栏：2023生信技能树学习记录2023生信技能树学习记录

title: "生信技能树学习笔记"

引用自生信技能树 author: "天空"

date: "2023-01-02"

output: html_document

一、函数和R包

1. 函数与参数

jimmy <- function(a,b,m = 2){
  (a+b)^m
}
jimmy(a = 1,b = 2)

## [1] 9

jimmy(1,2)

## [1] 9

jimmy(3,6)

## [1] 81

jimmy(3,6,-2)

## [1] 0.01234568

2. 用函数代替复制粘贴

#当一个代码需要复制粘贴三次，就应该写成函数或使用循环

jimmy <- function(i){
  plot(iris[,i],col=iris[,5])
}

jimmy(1)

jimmy(2)

jimmy(3)

jimmy(4)

二、R包

1. R包介绍

2. xxx包如何安装

3. 快速下载R包

# R包安装

options("repos"=c(CRAN="http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/"))
options(BioC_mirror="http://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/")

# install.packages("tidyr")
# install.packages('BiocManager')
# BiocManager::install("ggplot2")
# install.packages('devtools')
# devtools::install_github("jmzeng1314/idmap1") #括号里写作者用户名加包名

# 清华镜像
# http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/
# http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/bioconductor/
  
# 中科大镜像
# http://mirrors.ustc.edu.cn/CRAN/
# http://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/