脚本分享——对fasta文件中的序列进行排序和重命名
hello，hello！ 小伙伴们大家下午好，我是小编豆豆，时光飞逝，不知不觉来南京工作已经一年了，从2018年参加工作至今，今年是我工作最快乐的一年，遇到一群志同道合的小伙伴，使我感觉太美好了。
今天是2022年的最后一天，小编在这里给大家分享一个好用的脚本，也希望各位小伙伴明年工作顺利，多发pepper。
安装python模块
# 使用pip安装
pip install biopython
pip install pandas查看脚本参数
python Fasta_sort_renames.py -h
实战演练
# 只对fasta文件中的序列进行命令
python Fasta_sort_renames.py -a NC_001357.1.fna -p scoffold -s F -a rename_fasta.fna
# 对fasta文件中序列根据序列长短进行排序，并对排序后的文件进行重命名
python Fasta_sort_renames.py -a NC_001357.1.fna -p scoffold -s T -a rename_fasta.fna本文参与 腾讯云自媒体分享计划，分享自微信公众号。
原始发表：2022-12-31，如有侵权请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除
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