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生信星球每日学习day3-毽子

原创
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用户10300841
发布2023-01-11 22:21:21
6490
发布2023-01-11 22:21:21
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将miniconda下载到服务器上

百度/谷歌搜索“miniconda 清华”(是清华的conda镜像网站)

=》进入: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/ 你会看到linux下面有64-bit(x86_64)、32-bit(x86)两种版本

=〉接下来,查看服务器是多少位的:输入命令 uname -a

=》安装最新版本(latest)

=〉右键-复制下载链接

小提示 输入时可以试试自动补全功能,键盘上的Q前面那个Tab键,你在home目录下,打出cd b,按Tab就可以自动补齐。失败可以跳过. 生信星球

登陆服务器,进入biosoft目录

cd ~/biosoft

wget命令

wget 接复制下载链接

wget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh

安装miniconda

bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh

跟着操作,服务器让你按ENTER就按ENTER

让你按YES就按YES

出现此为安装成功

最后还得激活

source ~/.bashrc来激活conda

命令行输入conda

出现此即可

安装有问题,可以参考演示视频【无声版】

链接:https://share.weiyun.com/5J82l9g 密码:iwcd4k 生信星球

添加镜像:

# 使用中科大的镜像

使用conda

conda list #查看当前服务器上安装的所有软件列表

conda install fastqc -y #安装fastqc

默认安装最新版本,但是有的软件新版本bug比较多,可能需要用到老版本 

如果要指定版本号,可以conda install fastqc=0.11.7 -y

生信星球

3.确认fastqc软件是否安装成功

输入fastqc --help,如果出现一大片文字,这是软件的帮助文档。因为只有安装成功的软件才能看到帮助文档,所以出现了这篇帮助文档,就可以确定已经安装成功。

4.conda remove fastqc -y卸载软件

原创声明:本文系作者授权腾讯云开发者社区发表,未经许可,不得转载。

如有侵权,请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除。

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