生信学习小组Day 6-学习R包（L）

1.安装和加载R包

1.镜像设置

两行代码可以搞定~ 链接如下：

生信星球

2.安装

输入代码install.packages(“包”)或BiocManager::install(“包”)。

3.加载

先安装，再加载，使用library和require，两个函数均可。

2.dplyr五个基础函数

1.mutate()新增列

输入代码mutate(test,new = Sepal.Length * Sepal.Width)

2.select(),按列筛选

输入代码vars <- c("Petal.Length", "Petal.Width")和select(test, one_of(vars))

3.filter()筛选行

输入代码filter(test, Species == "setosa")

4.arrange(),按某1列或某几列对整个表格进行排序

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5.summarise()：汇总

对数据进行汇总操作,结合group_by使用实用性强

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3.dplyr两个实用技能

1.管道操作 %>% (cmd/ctr + shift + M)

将左边的运算结果，以输入的方式传递给右边的函数

2：count统计某列的unique值

4.dplyr处理关系数据

1.内连inner_join

取交集

2.左连left_join

左边的数据全部保留

3.全连full_join

4.半连接semi_join

返回能够与第二个表匹配的第一个表所有记录

5.反连接anti_join

返回无法与第二个表匹配的第一个表所有记录

6.合并

bind_rows()函数需要两个表格列数相同，而bind_cols()函数则需要两个数据框有相同的行数