学习小组Day3笔记--刘

软件下载器

日常中就可以用MINICONDA

下载MINICONDA

途径: MINICONDA 清华

下载最新的版本,还需注意系统是64还是32,用uname -a看

打开下载页面,右键点击复制下载链接

wget 刚才你复制的下载链接，如下图

「for Windows」请记住这里的粘贴不是ctrl+c和ctrl+V了，选中，鼠标左键点一下是复制，右键点一下是粘贴；

sh是脚本（就是一个程序，后台的代码）文件的后缀，也就是说其实这是一个下载的脚本，如果你安装失败了，这个脚本是不需要重新下载的，还是可以用的。

安装

bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh 

激活 很重要!!!

source ~/.bashrc来激活conda

命令行输入conda，出现满屏的信息说明成功了

# 添加镜像

`

使用中科大的镜像

conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/

conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/

conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/free/

conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/main/

conda config --set show_channel_urls yes

开始使用CONDA

conda list

查看当前服务器上安装的所有软件列表

安装软件

conda install fastqc -y 【-y是yes，安装过程中conda问你的问题全部回答yes，你可以试试不加-y有什么区别】

fastqc --help

帮助文档,也可以确定软件安装成功

卸载软件

conda remove fastqc -y