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生信入门课DAY3--向逸一

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向11
修改2023-02-09 09:24:13
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1、将miniconda下载到服务器上

代码语言:javascript
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wget +下载链接

(下载链接https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh)

2、安装miniconda

step1:安装

代码语言:javascript
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bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh 

(按提示操作,直至thank you for installing Miniconda3)

step2:激活

代码语言:javascript
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source ~/.bashrc

(验证激活,输入conda出现满屏信息代表激活成功)

如果激活不成功,删除文件(rm -r /home/bio06/miniconda3),重新安装

3、添加镜像

代码语言:javascript
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# 使用中科大的镜像
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --set show_channel_urls yes

4、使用conda

step1:查看当前服务器上安装的所有软件列表

代码语言:javascript
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conda list

step2:安装软件

代码语言:javascript
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conda install fastqc -y 

【-y是yes,安装过程中conda问你的问题全部回答yes】

step3:确认fastqc软件是否安装成功

代码语言:javascript
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fastqc --help

如果出现一大片文字(帮助文档),已经安装成功

step4:卸载软件

代码语言:javascript
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conda remove fastqc -y

原创声明:本文系作者授权腾讯云开发者社区发表,未经许可,不得转载。

如有侵权,请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除。

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  • 1、将miniconda下载到服务器上
  • 2、安装miniconda
    • step1:安装
      • step2:激活
      • 3、添加镜像
      • 4、使用conda
        • step1:查看当前服务器上安装的所有软件列表
          • step2:安装软件
            • step3:确认fastqc软件是否安装成功
              • step4:卸载软件
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