生信星球学习小组-Day6学习笔记--学习R包

安装和加载R包

1.配置镜像

为了一劳永逸地完成镜像配置，我们需要在将镜像链接设置在R的初始配置文件.Rprofile里。

options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/")) # CRAN的清华镜像源
options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/") # Bioconductor的中科大镜像源

2.安装R包

R包安装命令是install.packages(“R包名”)

或者BiocManager::install(“R包名”)

3.加载R包

一般使用library(“R包名”)加载R包

dplyr包的学习

1.五个基本函数

首先构建一个储存数据的变量test

• 新增一列数据mutate()
  
• 挑选不同列的数据select() ① 按照每列的编号筛选

② 按照每列的列名筛选

• 筛选不同行的数据filter()

• 按某1列或某几列对整个表格进行排序arrange()

• 汇总summarise()

2.连接不同的数据框

• 按一定规则进行连接

首先创建数据框并赋值

• 简单合并数据框`

首先创建数据框

3.实用技巧

• 管道操作%>%

test %>% group_by(Species) %>% summarise(mean(Sepal.Length), sd(Sepal.Length))
# %>% 意思就将前面的内容作为后面的处理对象，依次执行下去
# 与下面这行代码处理效果一致
summarise(group_by(test, Species),mean(Sepal.Length), sd(Sepal.Length))

• 统计某列不同元素的个数count()