学习生信时,最常用的可视化软件就是R,可大家在使用的时候又好像用的是Rstudio,究竟什么是R和Rstudio?
R是一种编程语言,也是统计计算和绘图的环境,它汇集了许多函数,能够提供强大的功能。
RStudio是免费提供的开源集成开发环境(IDE)。RStudio提供了一个具有很多功能的环境,使R更容易使用,是在终端中使用R的绝佳选择。
进入R的官网https://www.r-project.org/
第一步
点击红框中的download R
第二步
在镜像这里中选择第一个
第三步
接下来按照红框点点点就能完成R的安装
第四步
第五步
R语言软件界面简陋,通常不直接使用,而是用图形界面的Rstudio。
进入Rstudio的官网https://www.rstudio.com/ 点击Products
往下翻到桌面版,点击download选择适合你的版本即可
Rstudio基本界面
Tools→Global options
Appearance选项可以设置字体大小以及主题等
具体可以参照我的设置
dir() #查看工作路径下文件,类似于Linux系统下的ls
list.files() #同上
示例
和其他编程语言相同,直接输入即可
示例
赋值符号 <- 或 ALT -
x <- 2+3 #将2+3的结果赋值给x
y <- 5/6 #将5/6的结果赋值给y
赋值结束后即可在右上角environment栏中看到现在赋值过的变量
x <- 2+3 #将2+3的结果赋值给x
y <- 5/6 #将5/6的结果赋值给y
rm(x,y) #删除x和y变量
rm(list = ls()) #清空所有变量
history() #列出所有使用过的命令
或直接点击右上角History一栏中查看
CTRL L
setwd() #设置工作目录
getwd() #查看工作目录
当有多个项目需要进行,而命名又不是特别显而易见时,很容易出现文件找不到或者杂乱无章的情况,因此创建多个工作目录有利于解决多项目的问题。
第一步
第二步
第三步
第四步
需要注意的是,大家在命名的时候一定不要出现中文哦! 这就大功告成啦!
参考资料:https://m.bilibili.com/video/av25643438.html