Linux||conda的安装及使用

小汪Waud

发布于 2023-02-16 15:23:09

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发布于 2023-02-16 15:23:09

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什么是conda？ conda是一个开源的软件包管理系统和环境管理系统，用于安装多个版本的软件包及其依赖关系，并在它们之间轻松切换。

通过conda安装软件 1.省时省力省bug 2.方便管理和更新 3.安装时不用配置环境变量

01 安装anaconda/miniconda

首先进入anaconda的网址 https://www.anaconda.com/

点击Products的Individual Edition

翻到下面，选择Linux的版本

此时会跳出来一个链接，不要直接下载，我们切到服务器界面输入

wget https://repo.anaconda.com/archive/Anaconda3-2021.05-Linux-x86_64.sh

下载miniconda是一样的，但conda已经内置了一些软件。

此时我们ls发现多了一个.sh的文件对于.sh(shell格式)的文件，我们直接用sh(如果出问题就用bash)去运行

提示很明确了，press enter 后面再遇到提示直接enter和yes

在安装的过程中，软件会询问安装路径，如果是个人使用，默认安装路径就可；如果你是管理员，最好自己创建一个公共的文件夹。

02 添加环境变量

如果在安装conda的最后一步时，你选择了yes，那么它会自动给你环境变量，直接source一下即可使用。

source .bashrc

可如果你选择了no，那你可得自己添加环境变量,找到它的安装目录然后添加到环境变量中。

vi .bashrc
 export PATH="/home/bio04/anaconda/bin:$PATH

退出以后source一下

03 配置镜像

# 使用清华镜像
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
conda config --set show_channel_urls yes

如果不行就

# 先删除原来的 
rm ~/.condarc
# 切换北京外国语镜像
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --set show_channel_urls yes

04 conda使用

1.搜索软件

conda search r

2.安装软件

conda install r -y # -y表示yes，安装过程中所有的提示统统帮你yes

3.卸载软件

conda remove r -y

4.查看conda已安装的软件

conda list

因为我用的anaconda，所以默认安装了许多软件

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原始发表：2021-05-19，如有侵权请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除

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bash

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