前往小程序,Get更优阅读体验!
立即前往
首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布
社区首页 >专栏 >【画图】如何对clusterProfiler富集结果进行筛选并画图?

【画图】如何对clusterProfiler富集结果进行筛选并画图?

作者头像
Chris生命科学小站
发布2023-02-28 18:53:05
6650
发布2023-02-28 18:53:05
举报

前言

Y叔神包(clusterProfiler)[1],用起来是真的很舒服。注释基因功能,看看有啥通路全靠他。做好富集以后,一个简单的代码,整体的结果即刻展现。比如下面这个图,

那么如何挑选其中一个节点或者几个节点展示呢?比如挑选其中的lymphocyte chemotaxissecondary alcohol metabolic process展示

Y叔的Github里面和原来的教程中有个包是clusterProfiler.dplyr,可以进行筛选操作,不过最近Y叔在更新,这个包暂时没有了。有的小伙伴还想对富集结果进行筛选怎么办呢?

画图代码如下

本文参与 腾讯云自媒体分享计划,分享自微信公众号。
原始发表:2020-03-20,如有侵权请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除

本文分享自 Chris生命科学小站 微信公众号,前往查看

如有侵权,请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除。

本文参与 腾讯云自媒体分享计划  ,欢迎热爱写作的你一起参与!

评论
登录后参与评论
0 条评论
热度
最新
推荐阅读
领券
问题归档专栏文章快讯文章归档关键词归档开发者手册归档开发者手册 Section 归档