Linux文本编辑器vim的使用2-14

Vim的三种模式：

命令模式

编辑模式

末行模式

vim [file] 

进入命令模式后，使用”i“，进入编辑模式，按ese退出，返回命令模式

进入命令模式后，使用”:“，进入末行模式，按ese退出，返回命令模式

命令模式可以干什么？

编辑模式可以干什么？

末行模式可以干什么？

1.保存并退出

:q!

:wq

:q

:wq!

2.查询

:/关键词，n向下翻 N向上翻

3.set

:set nu #显示行号

:set nonu #不显示行号

:set list #显示不可见的字符

:set ff=unix

4.替换：

:%s///g #全部替换

:s///g #替换所在行

:s/// #替换光标所在行的第一个

:%s/// #替换所有行的第一个

处理Vim打开文件异常：

1.多次打开 ——>退出

2.断开连接（网断了） ：d（删除断网前的编辑后再打开） 、r（）

生信的几种常见数据格式：

1.fasta(.fa)

fa数据的内容

2.fastq （fq）

以4行为一个单位 一个单位代表一个序列

@ 标识符及描述信息（测序仪序列号等）

序列信息（ATCGN）

• 或者+及第一行信息 为保留行

碱基质量值 与碱基一一对应 表示测序对应碱基的准确性

3.gff 基因组注释文件 共有9列

gff文件包含的内容

行与行之间有并列or 包含关系

可以使用colunm -t 来让列对其

4.gtf 文件

gtf文件包含的内容