3.9生信

matrix ：矩阵，整个表只允许一种数据类型

data.frame：数据框，每一列只允许一种数据类型

可以根据生成的函数或者用class或者is族函数判断。

数据框的来源：

可由代码新建、已有数据转换或处理、读取表格文件、R语言内置数据

内置数据多用于新手练习，eg：iris、volcano、letters、LETTERS

新建数据框：

代码新建

##A. 数据框属性

dim(df1) 数据框属性，返回行数列数

nrow(df1) 数据框行数

ncol(df1) 数据框列数

rownames(df1) 数据框行名

colnames(df1) 数据框列名

##B. 数据框取子集

a.$

df1$gene #删掉“gene”，按tab键，可以提示出表格的全部列名

小技巧：在今后把 df1$gene 看作一个整体，是一个向量，这样不容易产生困惑。

b.按照坐标

df1【3,2】 取出第3行第2列

df1【3,】 取出第3行

df1【,2】 取出第2列（但不常用，不如$，$可以直接看出列名）

df1【c(1,3),1:2】 取出第1，第3行的第1和第2列

c. 按名字

df1【,"gene"】

df1【,c('gene','change')】

d.按条件（逻辑值）

df1【df1$score>0,】

取子集的逻辑值向量必须与X对应，但不需要由X生成

如何取数据框的最后一列？

ncol(df1) 知道了行数就方便取最后一列：df1【,ncol(df1)】 这样子方便代码复用。

如何取数据框除了最后一列以外的其他列？

df1【,-ncol(df1)】

“-”是针对数据使用，“!”是针对逻辑值使用

C.数据框修改

a.改一个格

df1【3,3】 <- 5

b.改一整列

df1$score <- c(12,23,50,2)

c.改行名和列名

rownames(df1) = c("r1","r2","r3","r4") 修改行名

d.只修改某一行/列的名

colnames(df1)【2】 = "CHANGE" 将第二列的名字改为CHANGE

e.两个数据框的连接merge

merge(test1,test2,by="name") 将test1和test2a按照name连接。

merge(test1,test3,by.x = "name",by.y = "NAME")

当test1和test2的列名不一样是，按照上述公式连接。

all.x = all, all.y = all，“不放弃每一个人”，不舍弃无法合并的内容

小结

矩阵

取子集：不支持$

新建矩阵：

m = matrix(1:9, nrow = 3)

colnames(m) = c("a","b","c") #加列名

rownames(m) = c("q","w","e") #加行名

矩阵的转置和转换：

转置：t(m) 行变列，列变行

转换：as.data.frame(m) 转换为数据框

列表

列表新建和取子集

新建

q = list(m1 = matrix(1:9, nrow = 3),

m2 = matrix(2:9, nrow = 2))

取子集

如果有m1、m2这些元素名字，可以用$取子集；

如果没有m1、m2这些元素名字，用双括号取子集。 q【【2】】

names函数获取元素名字

names(m1)

names(test1)

names 函数不仅仅能对列表使用，还可以对数据框使用（返回列名）。

也可以对向量使用：

names(scores) = c("a","b","c")

names(scores)【scores>60】

删除变量

rm(l) 删除一个变量

rm(df1,m) 删除多个变量

rm(list = ls()) 删除全部变量

Ctrl+ L 清空控制台

总结