Linux_文件查看、操作、统计命令

head / tail -n ：查看文件的前/后 n 行，默认 10 行
例如：head -n 2 Data/example.fq

-A ## 打印所有内容，包括特殊字符，如制表符
-n ## 打印出所有行号，-b 参数仅打印非空白行行号

cat   #输入
cat > file1   #重定向，往file1文件里面输入内容，再按 ctrl+c 暂停任务，file是一个文件
cat file1   #写完后，打印file1文件中的内容

zcat：可以查看压缩的文本文件
tac：逆向查看

cat Data/example.gtf | head -n 3  # | 管道符。前面的输出作为后面的输入。管道符后面要加命令。

-N：显示行号
-S：单行显示
zless：查看压缩文件
用“/keyword”进行关键词查询    #进入文件后再进行关键词的查询
n/N：上下浏览关键词

-l #统计行数
-w #统计字符串数
-c #统计字节数

-d #指定分隔符，默认\t；
-f #输出哪几列（字段fields）

例如：-f
less -SN Data/example.gtf | cut -f 1,3-5,7 |head

例如：-d
less -S Data/example.gtf | cut -d 'h' -f 1 | head -2

-n：按照数值从小到大进行排序
-V：字符串中含有数值时，按照数值从小到大排序
-r：逆向排序
-k：指定按哪一列排序
-t：指定分隔符

-c：统计每个字符串连续出现的行数

例如
cat Data/example.gtf | cut -f 3 | head -20 | sort
cat Data/example.gtf | cut -f 3 | sort| uniq

-d：指定分隔符
-s：按行合并

1. paste file1 file2 
2. seq 20 | paste - -

-d：删除指定字符
-s：缩减连续重复字符