生信星球学习小组 DAY3 conda的使用

Conda的安装

wget -c https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh 下载miniconda安装包

bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh 安装文件夹内下载好的miniconda安装包

安装完成后 .bashrc文件发生改变 需重新加载此文件 conda才能生效

重新加载.bashrc文件： source ~/.bashrc 用户名前出现(base)表示conda已被激活

查看服务器上已经安装的所有软件：conda list

创建conda小环境

创建名为env的conda小环境 conda create -n env

在conda小环境内安装软件

激活刚才创建的 env 小环境 conda activate env

在小环境内指定安装fastqc 0.11.7版本软件 conda install fastqc=0.11.7 -y

软件安装成功

查看小环境内安装的软件

卸载小环境中已安装的软件 conda remove -y fastqc

退出创建的env小环境回到了base环境中 conda deactivate

再次运行 conda deactivate 可完全退出conda