生信学习小组DAY5

（1）R的赋值符号不是等号，而是<-

（2）在Console 控制台输入命令，相当于Linux的命令行

（3）R的代码都是带括号的，括号必须是英文的。

（4）显示工作路径 getwd()

（5）向量是由元素组成的，元素可以是数字或者字符串。

（6）表格在R语言中改名叫数据框

（7）函数或者命令不会用时，除了百度/谷歌搜索以外，用这个命令查看帮助：?read.table，调出对应的帮助文档，翻到example部分研究一下。

向量

标量：一个元素组成的变量

向量：多个元素组成的变量

（补充：一个向量是一排有序排列的元素，以后会用到把一个向量作为数据框中的一列的情况。）

生信星球

赋值

如果把这几行代码都打过了，那么x就被赋值了4次，结果就是，第一次赋值被第二次的覆盖了，第二次的赋值又被第三次的覆盖了，以此类推，以最后一次为准

从向量中提取元素

元素位置

x4 #x第4个元素

x-4#排除法，除了第4个元素之外剩余的元素

x2:4#第2到4个元素

x-(2:4)#除了第2-4个元素

xc(1,5) #第1个和第5个元素

根据值

xx==10#等于10的元素

xx<0

xx %in% c(1,2,5)#存在于向量c（1，2，5）中的元素

数据框

X=read.table("\Rstudiotestdoudou.txt",header=T,sep = ',')

读取本地数据

设置行名和列名

X<-read.csv('doudou.txt')

colnames(X) #查看列名

rownames(X) #查看行名,默认值的行名就是行号，1.2.3.4...

colnames(X)1<-"bioplanet"#有的公司返回数据，左上角第一格为空，R会自动补为x,用这个命令来修改

X<-read.csv(file = "huahua.txt",sep = " ",header =T,row.names=1)#最后row.names的意思是修改第一列为行名

数据框的导出

write.table(X,file = "yu.txt",sep = ",",quote=F)

变量的保存与重新加载

这次没有处理完的数据下次想接着用怎么办?--学会保存和重新加载。保存的格式是RData。

save.image(file="bioinfoplanet.RData")#保存当前所有变量

save(X,file="test.RData")#保存其中一个变量

load("test.RData")#再次使用RData时的加载命令

##提取元素

X指变量名称，根据变量名称来改变

• Xx,y#第x行第y列
• Xx,#第x行
• X,y#第y列
• Xy #也是第y列
• Xa:b#第a列到第b列
• Xc(a,b)#第a列和第b列
• X$列名#也可以提取列（优秀写法，而且这个命令还优秀到不用写括号的地步，并且支持Tab自动补全哦，不过只能提取一列）