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Day4——查布铎徳勒

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用户10663172
发布2023-07-21 00:39:14
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发布2023-07-21 00:39:14
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文章被收录于专栏:wj生信学习笔记wj生信学习笔记

学习R包

安装和加载R包

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options("repos"=c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/"))
options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/") #以上都是镜像设置,为了加速下载R包
install.packages('dplyr') #安装“dplyr”包
library(dplyr) #加载“dplyr”包

使用 iris的简化版

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test<-iris[c(1:2,51:52,101:102),]

dplyr五个基本函数

1.mutate(),新增列

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mutate(test,new=Sepal.Length*Sepal.Width)

2.select(),按列筛选

按列号筛选
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select(test,1)
select(test,c(1,5))
select(test,Sepal.Length)
按列名筛选
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select(test, Petal.Length, Petal.Width)
vars <- c("Petal.Length", "Petal.Width")
select(test, one_of(vars))

3.filter(),筛选行

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filter(test, Species == "setosa")
filter(test, Species == "setosa"&Sepal.Length > 5 )
filter(test, Species %in% c("setosa","versicolor"))

4.arrange(),按某一列或某几列对整个表格进行排序

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arrange(test, Sepal.Length) #默认从小到大排序
arrange(test, desc(Sepal.Length)) #用desc从大到小

5.summarise(),汇总

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summarise(test, mean(Sepal.Length), sd(Sepal.Length)) # 计算Sepal.Length的平均值和标准差
group_by(test, Species) # 先按照Species分组,计算每组Sepal.Length的平均值和标准差
summarise(group_by(test, Species),mean(Sepal.Length), sd(Sepal.Length))

dplyr两个实用技能

(加载任意一个tidyverse包即可用管道符号)

1.管道操作%>%(cmd/ctr+shift+M)

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test %>%
+ group_by(Species) %>%
+ summarise(mean(Sepal.Length), sd(Sepal.Length))

2.count统计某列的unique值

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count(test,Species)

dplyr处理关系数据

即将两个表进行连接

test1 <- data.frame(x = c('b','e','f','x'), z = c("A","B","C",'D'))

test2 <- data.frame(x = c('a','b','c','d','e','f'), y = c(1,2,3,4,5,6))

1.内连inner_join,取交集

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inner_join(test1, test2, by = "x")

2.左连left_join

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left_join(test1, test2, by = 'x')
left_join(test2, test1, by = 'x')

3.全连full_join

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full_join( test1, test2, by = 'x')

4.半连接:返回能够与y表匹配的x表所有记录semi_join

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semi_join(x = test1, y = test2, by = 'x')

5.反连接:返回无法与y表匹配的x表所有记录anti_join

代码语言:txt
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anti_join(x = test2, y = test1, by = 'x')

6.简单合并

test1 <- data.frame(x = c(1,2,3,4), y = c(10,20,30,40))

test2 <- data.frame(x = c(5,6), y = c(50,60))

test3 <- data.frame(z = c(100,200,300,400))

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bind_rows(test1, test2)
bind_cols(test1, test3)

原创声明:本文系作者授权腾讯云开发者社区发表,未经许可,不得转载。

如有侵权,请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除。

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  • 学习R包
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      • dplyr五个基本函数
        • 1.mutate(),新增列
        • 2.select(),按列筛选
        • 3.filter(),筛选行
        • 4.arrange(),按某一列或某几列对整个表格进行排序
        • 5.summarise(),汇总
      • dplyr两个实用技能
        • 1.管道操作%>%(cmd/ctr+shift+M)
        • 2.count统计某列的unique值
      • dplyr处理关系数据
        • 1.内连inner_join,取交集
        • 2.左连left_join
        • 3.全连full_join
        • 4.半连接:返回能够与y表匹配的x表所有记录semi_join
        • 5.反连接:返回无法与y表匹配的x表所有记录anti_join
        • 6.简单合并
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