Day6——查布铎徳勒

软件管理Miniconda

生信方面小而精的软件下载器

将miniconda下载到服务器上

搜索‘Miniconda 清华’
进入  https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/ 
查看服务器多少位: uname -a
安装最新版本
复制链接
进入“biosoft”目录: cd ~/biosoft
wget ‘复制的链接’

安装miniconda

bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
sourse ~/.bashrc #激活

添加镜像：conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/ conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/

conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/free/

conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/main/

conda config --set show_channel_urls yes

使用conda

1. conda list 查看安装软件
2. conda install fastqc —y 安装软件
3. fastqc ——help 查看是否安装成功
4. conda remove fastqc —y 卸载软件