前往小程序,Get更优阅读体验!
立即前往
首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布
社区首页 >专栏 >生信星球学习小组Day5-数据结构 Jerry

生信星球学习小组Day5-数据结构 Jerry

原创
作者头像
jerry早点睡
发布2023-08-11 15:08:18
2060
发布2023-08-11 15:08:18
举报
文章被收录于专栏:jerry的学习笔记jerry的学习笔记

今天是学习小组学习的第5天,主要是学习了解R语言的数据结构

1. 新手笔记

R语言赋值符号是<-

R代码带英文括号

函数getwd()获取工作路径

R语言的向量数据结构由元素构成,元素可以是数字或字符串

我们熟悉的表格在R语言的数据结构是数据框

?加上函数可以查看相关的帮助文档

R语言的常用数据类型: 向量、矩阵、数组、数据框和列表

其中向量和数据框是重点

2. 向量

a. 向量的定义和构建

标量是由一个元素组成的变量;而向量则由多个元素组成

使用向量一般给变量赋值;向量有以下四种创建方式

代码语言:txt
复制
x<- c(1,2,3)  #最常用,c创建几个元素构成的向量
x<- 1:10  #:构建从1-10之间所有的整数
x<- seq(1,10,by = 0.5) #构建从1-10之间所有的整数,步长0.5
x<- rep(1:3,times=2) #重复两次1到3的整数

b. 从向量中提取元素

(1)根据元素位置

代码语言:txt
复制
x[4]  #提取第4个元素
x[-4]  #去除第4个元素
x[2:4]  #提取第2到4个元素
x[-(2:4)]  #去除第2-4个元素
x[c(1,5)]  #提取第1个和第5个元素

(2) 根据逻辑值

代码语言:txt
复制
x[x==10] #提取等于10的元素
x[x<0]  #提取小于0的元素
x[x %in% c(1,2,5)]  #存在x中在向量c(1,2,5)中存在的元素

3. 数据框

tip:运行项目时需要将文件放置于工作目录下;R中严格区分大小写;改错变量可以重新赋值覆盖;可以使用并保存脚本文件,文件格式为R

a. 读取本地数据

代码语言:txt
复制
a <- read.table(file = 'huahua.txt', sep = '\t',header = T) #read.table函数读取文件,sep表示分隔符,header指示文件是否包含变量的名称作为其第一行

b. 设置行名和列名

代码语言:txt
复制
colnames(X)  #查看列名
rownames(X)  #查看行名,默认值行名是行号
colnames(X)[1]<-"bioplanet" #如果左上角第一格为空,R会自动补为x,可以用这个命令来修改
X<-read.csv(file = "huahua.txt",sep = "	",header =T,row.names=1) #row.names的意思是第一列作为行名

c. 导出数据框

代码语言:txt
复制
write.table(X,file = "yu.txt",sep = ",",quote=F) #write.table导出,分隔符改为逗号,quote设置字符串不加双引号

d. 保存变量和重新加载

代码语言:txt
复制
#保存变量和重新加载可以让没有处理完的数据下次想接着用,保存格式时RData
save.image(file="bioinfoplanet.RData")  #保存当前所有变量
save(X,file="test.RData")  #保存其中一个变量
load("test.RData")  #加载RData,导入保存的变量

e. 提取元素

代码语言:txt
复制
X[x,y] #第x行第y列
X[x,] #第x行
X[,y] #第y列
X[y]  #第y列,有列名
X[a:b] #第a列到第b列
X[c(a,b)] #第a列和第b列
X$列名#也可以提取列,可以用tab补齐,但只能获取一列

f. 直接使用数据框变量

代码语言:txt
复制
plot(iris$Sepal.Length,iris$Sepal.Width) #iris是R中的一个内置数据集数据框,可以直接使用,提取其中两列作散点图

save(X,file="test.RData")如果代码报错object X not found,说明X不存在,R找不到这个对象,需要建立X这个变量给他赋值

代码示例来自微信公众号生信星球

原创声明:本文系作者授权腾讯云开发者社区发表,未经许可,不得转载。

如有侵权,请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除。

原创声明:本文系作者授权腾讯云开发者社区发表,未经许可,不得转载。

如有侵权,请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除。

评论
登录后参与评论
0 条评论
热度
最新
推荐阅读
目录
  • 1. 新手笔记
  • 2. 向量
    • a. 向量的定义和构建
      • b. 从向量中提取元素
      • 3. 数据框
        • a. 读取本地数据
          • b. 设置行名和列名
            • c. 导出数据框
              • d. 保存变量和重新加载
                • e. 提取元素
                  • f. 直接使用数据框变量
                  领券
                  问题归档专栏文章快讯文章归档关键词归档开发者手册归档开发者手册 Section 归档