CNGBdb有哪些实用科学数据库？【小鼠器官发育时空转录图谱】 | CNGBdb-Question Time

MOSTA是首个系统清晰的小鼠器官跨时期空间基因表达图谱集。

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03 /MOSTA

小鼠器官发育时空转录图谱

db.cngb.cn/stomics/mosta/

MOSTA属于深圳国家基因库（CNGB）与深圳华大生命科学研究院共同打造的时空组专辑数据库系列，研究者们利用Stereo-seq技术构建出了世界上首个系统清晰的小鼠器官跨时期空间基因表达图谱集。这也是首次在单细胞分辨率水平上解析空间基因表达谱，为哺乳动物发育研究提供重要的数据参考，推动我们更好地认识胚胎的成长和器官发生，也为出生缺陷相关研究提供指导。

数据资源

MOSTA包含了53个矢状切片，解析了小鼠胚胎发育过程中，从E9.5到E16.5间共8个时间点，全胚胎范围的转录组时空动态变化。其中13个切片来自同一个E16.5胚胎的不同切面，构建了胚胎发育接近终末期的三维空间转录组图谱。

主要功能

MOSTA通过交互式可视化，方便用户查看和检索小鼠胚胎各个基因在不同时期的空间表达。用户可通过数据库主页面或导航栏，快速获取研究内容梗概、时空聚类分析结果、研究技术（Stereo-seq）简介、研究中使用分析软件及产生的数据资源信息，同时还能直接下载研究数据及分析文件等。

成果发表

Dr.羊&听课君图片原创：CNGBdb 魏晓锋

编辑：尐尐呅

其他图片来源于MOSTA官网