CNGBdb有哪些实用科学数据库？【蝾螈端脑发育与再生时空图谱】 | CNGBdb-Question Time

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04 /ARTISTA

蝾螈端脑发育与再生时空图谱

db.cngb.cn/stomics/artista/

ARTISTA属于深圳国家基因库（CNGB）与华大生命科学研究院共同打造的时空组专辑数据库系列，研究者们利用Stereo-seq技术首次绘制了再生模式动物的大脑时空单细胞图谱，并进一步在时空转录组水平描述了端脑再生过程，详细解析了墨西哥钝口螈端脑再生的细胞和分子机制，对理解哺乳动物大脑再生研究具有重要的指导意义。通过对所获数据的大规模整合分析，获得了一系列端脑发育与再生的空间转录组图谱（Axolotl Regenerative Telencehpalon Interpretation via Spatiotemporal Transcriptomic Atlas，ARTISTA）。

数据资源

ARTISTA包括不同损伤再生阶段（7个再生阶段）和发育时期（6个发育时期）的端脑样本，实现了对蝾螈大脑发育、再生过程中单细胞转录组的原位捕获及分析。

主要功能

ARTISTA是一个空间解析的转录组数据资源，可以在单细胞分辨率上可视化蝾螈端脑再生和发育阶段的基因表达，旨在为蝾螈大脑神经再生的分子事件提供系统的解剖，为进一步的机制研究奠定基础。基于此专辑数据库，研究人员可以在空间图谱中快速探索他们感兴趣的细胞类型在端脑蝾螈不同再生发育阶段的基因表达谱。用户可通过数据库主页面或导航栏，快速获取此项研究的内容梗概、时空组聚类分析结果、研究技术（Stereo-seq）简介、研究中使用分析软件及产生的数据资源信息，同时还能直接下载研究数据。

成果发表

Dr.羊&听课君图片原创：CNGBdb 魏晓锋

编辑：尐尐呅

其他图片来源于ARTISTA官网