OTU/ASV和系统发育树不匹配的一个解决方案

最近好几个人遇到了同样的问题，就是在将OTU/ASV和系统发育树对齐的时候，报错：

意思是OTU/ASV名字和系统发育树的节点全都不匹配，导致树上的节点全都被去掉了，树就变成了NULL。

这种问题的出现基本上都是进化树导致的。需要仔细查看进化树文件是否正确。在R中读入进化树：

查看一下树，正确的格式应该是这样的：

但是，如果你的数据是某公司分析的，他们返回的树文件可能是这样的：

OTU/ASV名字多了单引号。而单引号也会被当成树节点的一部分，因此就和OTU/ASV不一致，导致全不匹配。。。

解决的办法也很简单，把树节点单引号替换掉即可：

完整的代码如下：