大家好, 我是邓飞。
今天聊一下遗传力的计算方法。
广义遗传力(
)定义为归因于基因型总体遗传变异的表型变异比例。通常他包括三个解释:(详见我这篇博客的公式推导 回归系数 相关系数 遗传力的关系)
有两个主要原因说明植物育种中对输入平均值的遗传力感兴趣(Schmidt等人,2019a):
Two stage,两阶段方法,就是先计算单个地点的育种值,然后再计算一年多点或者多年多点的数据,这里多个年份或者多个地点,都看做是不同的环境。One stage是一步到位的MET的分析方法,可以是一年多点,或者是多年多点,都在一个模型中进行分析。
这里的表型方差组分为:
这里的n_e,是环境的个数,n_r是重复的个数。
这里,Y是年份,E是地点,公式中包括:
表型方差的计算方法:
每一项,都除以对应的重复数。如果数据有缺失值,用调整均值进行分析,方法参考:
第一种,标准方法,我们最常用的,Vg/Vp,根据一年多点或者多年多点,计算出表型的方差组分,然后用下面公式计算:
第二种,Cullis方法
第三种:Piepho方法