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4月21日~23日,由IEEE, 浙江大学主办,深圳国家基因库(CNGB) 等单位协办的第11届生物信息学与计算生物学国际会议(ICBCB2023)在杭州顺利举行。国家基因库生命大数据平台(CNGBdb)亮相ICBCB2023大会特邀报告,获得生物信息与计算生物学领域研究人员的广泛关注。
ICBCB每年举行一次,旨在为生物信息学和计算生物学提供交流讨论的平台,促进科研创新和合作,推动学科交叉融合和发展。
4月22日,在大会特邀报告环节,国家基因库生命大数据平台生物信息助理研究员李小强作为特邀嘉宾,以《CNGBdb:一个用于生命科学多组学数据共享和分析的综合数据平台》为题,介绍了国家基因库生命大数据平台(CNGBdb)的主要功能、数据资源及其应用。针对生命科学大数据在存储、分析、共享方向面临的挑战,李小强老师还重点展示了CNGBdb在国际合作与认可、数据存储、可信计算、时空组数据共享应用方面的功能及其相关成果。CNGBdb的亮相获得现场专家的广泛认可及关注。
特邀嘉宾国家基因库生命大数据平台生物信息助理研究员李小强介绍CNGBdb
国家基因库生命大数据平台(CNGBdb)为全球科研工作者提供生物大数据智能搜索、汇交管理、可信计算和科学应用等服务,建立大数据搜、存、算、用为一体的闭环,助力科研合作、成果发表,促进生物、医学、农业等产业发展。
国家基因库生命大数据平台(CNGBdb)
db.cngb.org/
本次会议CNGBdb重点展示了三大重要功能:存-数据管理和文章发表助手——国家基因库序列归档系统(CNSA);算-"0"基础数据在线分析平台——生命大数据可信计算平台CODEPLOT;用-时空组学数据库(STOmicsDB)。
# 存
CNGBdb-存数据/发文章
CNSA是一个支撑全球组学研究成果汇交和管理的系统,致力于多组学数据(基因组、转录组、代谢组、单细胞和空间转录组等)的开放和共享,为全球科研人员提供更加安全、稳定、可靠、便捷的数据归档服务,促进多组学数据的再利用,推动全球生命科学的发展。截至目前,CNSA已支持论文发表1143篇,发表期刊338种,包括The Lancet、Science、Cell等。
CNSA db.cngb.org/cnsa/ 左右滑动查看更多
# 算
CNGBdb-可信计算平台
CODEPLOT是一个集可信计算环境和多元化在线分析工具于一体的生命大数据分析平台,也是国内率先将数据加密、区块链、安全多方计算、基因安全容器虚拟化等最新安全策略应用于生命大数据分析利用和合作共享的平台。用户无需任何编程背景,就可使用该平台的计算工具进行自动化的生物信息学分析。CODEPLOT为生命科学领域的研究和行业提供了数据共享、工作流管理、弹性云计算资源和安全可信协作环境的全面解决方案。
国家基因库生命大数据可信计算平台(CODEPLOT)
db.cngb.org/codeplot
# 用
CNGBdb-时空组学数据库
空间转录组学是一个迅速发展的领域,有望以单细胞或亚细胞分辨率全面表征组织结构。2022年CNGBdb重磅上线的时空组学数据库(STOmicsDB)首次建立时空组数据归档标准,实现时空组学不同层次数据的整合,并形成时空组学数据生态圈,是国际领先的时空组学综合平台,致力于促进时空组学的数据探索和学术研究。
截至目前,STOmicsDB已支撑Nature、Science、Cell在内的11篇文章发表,包括【全球首批生命发育时空图谱】覆盖小鼠、斑马鱼、果蝇、拟南芥四种模式生物胚胎或器官发育,【全球首个蝾螈脑再生时空图谱】等。
时空组学数据库(STOMICS DataBase)
db.cngb.org/stomics/
此外,CNGBdb收录和整合了国家基因库及全球其他重要数据源的多领域数据资源,构建覆盖生命科学研究各领域的30+专有数据库,以优质的数据和专业的分析工具,帮助研究人员挖掘数据资源、推动科学发现。
未来,国家基因库生命大数据平台(CNGBdb)将继续秉承“安全、开放、共享”的原则,扩大与各领域科研机构、产业单位的多维合作,继续发挥大数据技术优势,最大化释放生命大数据应用/转化价值,助力生命科学、医学、农业等领域创新发展