CNGBdb有哪些实用科学数据库？【斑马鱼胚胎发生时空转录组图谱】 | CNGBdb-Question Time

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06 /ZESTA

斑马鱼胚胎发生时空转录组图谱

db.cngb.cn/stomics/zesta/

ZESTA属于深圳国家基因库（CNGB）与华大生命科学研究院共同打造的时空组专辑数据库系列，研究团队利用时空组学技术，结合多切片策略，在单细胞分辨率水平上，对斑马鱼受精后24 h（hpf, hour post-fertilization）以内6个关键时间点（3.3、5.25、10、12、18、24 hpf）的胚胎进行研究。研究人员首次绘制了斑马鱼胚胎早期发育的时空转录组图谱（zebrafifish embryogenesis spatiotemporal transcriptomic atlas，ZESTA），构建了在组织空间维度上的发育轨迹。此研究能够直观地观察到，在原位组织上细胞是如何分化、迁移并发育形成各组织器官的。

数据资源

ZESTA利用时空组学技术分析了斑马鱼胚胎发育过程中基因表达和调控网络的时空动态。该数据库分析了91个胚胎切片，涵盖了发育的前24小时内的6个关键时间点，获得了10x10x15µm3（接近细胞大小）分辨率的152,977个点的空间坐标。

主要功能

ZESTA利用时空组学技术分析了斑马鱼胚胎发育过程中基因表达和调控网络的时空动态。用户可通过数据库主页面或导航栏，快速获取此项研究的内容梗概、时空和单细胞转录组聚类分析结果、空间分辨发展轨迹、研究技术（Stereo-seq）简介、研究中使用分析软件及产生的数据资源信息，同时还能直接下载研究数据。

成果发表