Day4—江海一

前言：

R包是多个函数的集合，具有详细的说明和示例。

学生信，R语言必学的原因是丰富的图表和Biocductor上面的各种生信分析R包。

包的使用是一通百通的，我们以dplyr为例，讲一下R包。

安装和加载R包

1.镜像设置

两行代码：

2.安装

R包安装命令是install.packages(“包”)或者BiocManager::install(“包”)

3.加载

library和require，两个函数均可。使用一个包，是需要先安装再加载，才能使用包里的函数。

dplyr五个基础函数

1.mutate(), 新增列

2.select(), 按列筛选

3.filter()筛选行

4.arrange(), 按某1列或某几列对整个表格进行排序

5.summarise()：汇总

dplyr两个实用技能

1：管道操作 %>% (cmd/ctr + shift + M)

（加载任意一个tidyverse包即可用管道符号）

2：count统计某列的unique值

dplyr处理关系数据:即将2个表进行连接

1.内连inner_join, 取交集

2.左连left_join

3.全连full_join

4.半连接：返回能够与y表匹配的x表所有记录semi_join

5.反连接：返回无法与y表匹配的x表的所记录anti_join

6.简单合并：在相当于base包里的cbind()函数和rbind()函数;注意，bind_rows()函数需要两个表格列数相同，而bind_cols()函数则需要两个数据框有相同的行数。