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5000万数量的单细胞工作里程碑

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生信技能树jimmy
发布2023-09-24 09:06:44
发布2023-09-24 09:06:44
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闲逛推特发现了5000万数量的单细胞工作里程碑:

5000万数量的单细胞工作里程碑

这个Chan Zuckerberg CELLxGENE (CZ CELLxGENE) 是由Chan Zuckerberg Initiative(CZI)支持的一个生物信息学工具,旨在促进单细胞基因表达数据的分析、可视化和共享。CZI是由Facebook创始人马克·扎克伯格和他的妻子普莉希拉·陈(Priscilla Chan)于2015年创立的慈善机构,其使命之一是推动生命科学研究领域的技术创新和数据共享。

CZ CELLxGENE 提供了一个强大的在线平台,用于处理和探索单细胞RNA测序数据。它的主要特点包括:

  1. 数据导入和处理:CZ CELLxGENE 支持导入和处理单细胞RNA测序数据,用户可以上传自己的数据或者使用公开可用的数据集。
  2. 数据分析:该工具提供各种数据分析功能,包括差异基因表达分析、聚类分析、细胞亚型识别和细胞轨迹分析等。用户可以使用这些功能来挖掘数据中的生物学信息。
  3. 可视化:CZ CELLxGENE 具有强大的数据可视化工具,用户可以生成各种图表和图形,以更好地理解数据。这些可视化工具包括降维可视化、热图、散点图等。
  4. 数据共享:平台允许用户将他们的数据和分析结果分享给其他研究人员,促进合作和数据共享。
  5. 生态系统整合:CZ CELLxGENE 与其他生物信息学工具和资源进行了整合,以便用户可以无缝地使用不同的工具来处理和分析数据。

我特意去它官方网站看了看:

官方网站

确实很让人激动,不仅仅是有如此数量级的单细胞数据,而且还分门别类整理存放好,供大家使用:

  • https://cellxgene.cziscience.com/collections

标准元数据注释的数据集可以下载 AnnData 和 Seurat 格式。

是不是可以去他们那边工作呢 ?

标准元数据注释的数据集可以下载 AnnData 和 Seurat 格式

本文参与 腾讯云自媒体同步曝光计划,分享自微信公众号。
原始发表:2023-09-23 11:33,如有侵权请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除

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