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生信星球学习小组day3--conda

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用户10800658
发布2023-10-22 11:18:55
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发布2023-10-22 11:18:55
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文章被收录于专栏:小欧生信学习
  • 💡conda--linux的应用商店 相当于app store,能够下载需要的软件
  • 💭 下载并安装miniconda
    • 谷歌搜索miniconda清华
    • 根据服务器位数找到下载链接
    • 登录xshell,cd biosoft
    • wget 下载的链接
    • 安装 bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
    • 激活 source ~/.bashrc,再输入conda
    • 添加镜像
  • 🏃‍♂️ cnoda的使用 越学越有意思,哈哈哈每天都期待早上十点的到来
    • conda list 查看服务器上安装的所有软件
    • conda install fastqc -y安装fastqc软件
    • fastqc --help,出现大片文字安装成功
    • conda remove fastqc -y卸载软件
  • 📖 conda环境
    • conda ifo --envs查看有哪些环境,带*的是激活的
    • 例:处理转录组数据,建立rnaseq的conda环境,指定python版本是3,安装fastqc\trimmomatic代码:conda create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y
    • 创建完成,conda info --envs再次查看环境
    • conda activate rna-seq激活新环境
    • conda deactivate推出当前环境
  • 笔记内容来源:生信星球学习小组

原创声明:本文系作者授权腾讯云开发者社区发表,未经许可,不得转载。

如有侵权,请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除。

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