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基因家族分析(4)一键完成从进化树到pfam

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R语言数据分析指南
发布2023-10-30 14:52:21
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发布2023-10-30 14:52:21
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文章被收录于专栏:R语言数据分析指南

❝基因家族分析是生物信息学入门学习的基石,由于其对硬件要求不高个人电脑均可进行,不仅投入小、操作简单,而且产出效果显著,因此受到了广大生物信息学初学者的喜爱。虽然相关的研究文章层出不穷,但许多内容趋于雷同,缺乏创新性。为了突破这一局限,「本次在第三版的基础上进行了全面的内容优化,并引入了多个Python自动化脚本,来简化分析过程」

原理介绍

❝本节来介绍,如何通过脚本来自动化完成「进化树构建,motif分析,pfam分析及其数据清洗」等多个步骤,一个脚本即可实现完成,只需要输入正确的输入文件及输出文件路径,非常的简洁。 ❞

实操展示

得到上述的分析结果,我们就可以绘制基因家族的第一张主图了

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原始发表:2023-10-29,如有侵权请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除

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