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GEO数据库 概述

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用户10803004
发布2023-10-31 17:50:13
3841
发布2023-10-31 17:50:13
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文章被收录于专栏:HYPER 基础

go分析、kegg分析

1、gene ratio(DE results)

gene ratio 是在该通路的差异基因与总差异基因的比值

2、bg ratio(organism-specific background)

bg ratio 是数据库中这条通路总共的基因比数据库中总共收录的基因

要注意,差异基因也是数据库中收录的基因

富集分析可视化分析

通路间的共同基因

展示共同基因的图
展示共同基因的图
同上,点的颜色表示adjp 线的颜色表示不同通路
同上,点的颜色表示adjp 线的颜色表示不同通路

GO term

有颜色的点表示富集到的通路,而灰色的点表示并没有富集到,但是大多数富集到的通路与其有密切关系
有颜色的点表示富集到的通路,而灰色的点表示并没有富集到,但是大多数富集到的通路与其有密切关系

原创声明:本文系作者授权腾讯云开发者社区发表,未经许可,不得转载。

如有侵权,请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除。

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  • go分析、kegg分析
    • 1、gene ratio(DE results)
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