Day3-Bran

什么是conda

Linux中的软件商店

如何下载conda

进入Ubuntu，输入uname -a,查看服务器位数

安装最新版本，复制下载链接

登陆服务器

1. 进入目录cd biosoft
2. inputwget address

安装miniconda

input bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh

     bash后面是miniconda的名字

enter 或者 yes

激活

    input`source ~/.bashrc`

添加镜像

使用conda

查看已安装的软件列表

conda list

安装软件

conda install fastqc -y

确认安装成功

fastqc --heip 如果出现一大段文字，则安装成功

卸载软件

conda remove fastqc -y

conda 环境

作用

同时容纳多个版本的软件

查看所处环境

conda info --envs

建立环境

建立一个名为rnaseq的conda环境

conda create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y

激活新建的环境

conda activate rna-seq

此时所处环境由base转移到rna-seq

退出当前环境

conda deactivate