跟着Nature Genetics学作图：R语言ggplot2散点图展示主成分分析（PCA）的结果

论文

Pangenome analysis reveals genomic variations associated with domestication traits in broomcorn millet

https://doi.org/10.1038/s41588-023-01571-z

论文中提供大部分图的原始作图数据，我们可以试着用论文中提供的原始数据来复现一下论文中的图

今天的推文来复现一下论文中的figure1b 和figure1c

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部分示例数据截图

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读取数据

论文中给landrace还分为 Chinese landraces (landrace C) from the European and Central Asian landraces (landrace O)

生成这个分组

这个代码的作用是把中国的省份摘出来，思路是中国省份的拼音是最少2个大写字母，然后再去除其他

figure1b作图代码

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figure1c的作图代码，思路和1b基本一致

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组合图

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示例数据可以到论文中下载，或者给推文打赏1元获取我整理的示例数据和代码