Day7-Bran 测序知识

测序知识

高通量组学

以下内容引用自：微信公众号/生信星球

1.基因组学（核酸序列分析）

（1）全基因组测序（WGS）

（2）全外显子组测序（WES）

（3）简化基因组测序（RRGS）

      ①RAD-Seq

      ②GBS

      ③2bRAD

      ④ddGBS（也就是ddRAD）

作用：

（1）基因组作图（遗传图谱、物理图谱、转录本图谱）

（2）核苷酸序列分析

（3）基因定位

（4）基因功能分析

其它：

以全基因组测序为目标的结构基因组学

以基因功能鉴定为目标的功能基因组学

2.转录组学（基因表达分析)

（1）mRNA-Seq

（2）IncRNA-Seq（长链非编码RNA）

（3）sRNA-Seq（主要是miRNA-Seq）

作用：

(1)获得物种或者组织的转录本信息

(2）得到转录本上基因的相关信息，如基因结构功能等

（3）发现新的基因

（4）基因结构优化

（5）发现可变剪切

（6）发现基因融合

（7）基因表达差异分析

3.蛋白质组学

（1）蛋白质组数据处理、蛋白及其修饰鉴定

   （2）构建蛋白质数据库、相关软件的开发和应用

   （3）蛋白质结构功能预测

   （4）蛋白质连锁图

4.代谢组学

（1）代谢物指纹分析

（2）代谢轮廓分析