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社区首页 >专栏 >Day3-崔崔:Linux环境下的软件安装

Day3-崔崔:Linux环境下的软件安装

原创
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坚不可崔同学
修改2024-01-18 09:03:43
890
修改2024-01-18 09:03:43

miniconda的安装,过程有点曲折,没有仔细阅读教程

安装成功
安装成功
最后要记得激活
最后要记得激活

使用conda

代码语言:r
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conda list 为查看当前服务器上安装的所有软件列表
conda list
conda list
代码语言:r
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conda install fastqc -y 安装软件 (-y是yes的意思)
两三分钟之后的样子
两三分钟之后的样子
代码语言:r
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fastqc --help 确认软件是否安装成功
有一大段文字
有一大段文字

还想理解一下conda环境

先查看当前conda有哪些环境

代码语言:r
复制
conda info --envs(前面带*的就是当前激活的)
结果显示,目前只有一个conda环境
结果显示,目前只有一个conda环境

厉害了,要处理转录组数据了!

先建立名字叫rnaseq的conda环境,然后指定python版本是3,安装软件fastqc、trimmomatic(两个可以一步完成)

生信星球

不明觉厉
不明觉厉
查看显示多了rna-seq
查看显示多了rna-seq
依旧不明觉厉
依旧不明觉厉
代码语言:r
复制
conda deactivate 退出当前环境

最后附上思维导图,思维导图大框填写在学习前,填充在课后复盘。

原创声明:本文系作者授权腾讯云开发者社区发表,未经许可,不得转载。

如有侵权,请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除。

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