第4天生信学习笔记-微信公众号生信星球

1.R需要的操作全部在自己电脑上，不涉及到服务器。

2.服务器可以配置自己的Rstudio，供大家远程登陆，用浏览器打开后面加上：8787就可以登录，但是阿里云并没有自带，用自己电脑完全可以。

今天的学习内容：

1.安装R（基础）和Rstudio（人性化一些的界面）

2.粗略了解R语言是什么，干什么的，认识Rstudio的工作界面

3.学会外观设置和基本操作

4.完成第一个R做的图

如果已经安装或者基础较好，可以看下R for Data Science的第一章，系统学习作图。

对照原书看，百度R  for Data Science 第一个结果就是了，免费。

第一步：查看你的电脑用户名是中文还是英文

第二步：预防中文用户名引起的麻烦

　　如果你的用户名不幸是中文的，那就必须改为英文，否则无法安装Rstudio。

【重要文件请保持云备份的习惯：坚果云、iCloud云盘都是非常好的双向同步云】

第三步：下载R和Rstudio

我的B站准备工作视频，本来是给线上直播课准备的，公开在B站了，可以免费看的。 【R软件和R包安装】 https://www.bilibili.com/video/BV1J44y1R7ci/?share_source=copy_web&vd_source=ba670d5a7ca081b044384f15866b88ef

注意：只看R和Rstudio的下载部分，剩下的非学习范围（不需要装R包）。

百度网盘里的软件下载链接：

链接：https://pan.baidu.com/s/1YVf9lvI5jiK_7pPcdAQtvA 

提取码：glgk

一.认识R和Rstudio

R是一种编程语言，也是统计计算和绘图的环境，它汇集了许多函数，能够提供强大的功能。 R语言软件界面简陋，通常不直接使用，而是用图形界面的Rstudio。

RStudio是免费提供的开源集成开发环境（IDE）。RStudio提供了一个具有很多功能的环境，使R更容易使用，是在终端中使用R的绝佳选择。

第一次上手，可以先做两个最简单的图： 用

plot(rnorm(50)) #必应查查plot和runif什么意思

boxplot(iris$Sepal.Length~iris$Species,col = c("lightblue","lightyellow","lightpink"))

注：iris是一个R语言自带的数据框，通常用作示例。iris$Sepal.Length表示iris数据框的Sepal.Length这一列数据。以此类推。

二.设置字体大小

三.R语言基本操作

1.用Rproject管理工作目录

所谓工作目录就是默认的读取和储存位置，也就是说，R语言只能和一个文件夹进行互动，这个文件夹非常重要，做不好就会导致你的脚本、文件、图片各种乱跑，找不到。

查看这一篇，养成好习惯： https://mp.weixin.qq.com/s/G-LXN9P2HVLv9v0cvyFJMA

2.显示文件列表

直接打命令不跟路径会显示哪里？显示默认路径，也就是工作目录。 相当于linux的ls。

dir()

零个对象？这可不是报错，这是因为你的工作目录里没东西。

所以我在工作目录下新建一个doudou.txt.再来试试（偷懒指南：向上箭头↑键）

这下不是零了。有豆豆.txt.了。

3.加减乘除

1+2 回车

4.赋值

赋值符号用<-，这是小于号加上减号，也可以按Alt加上减号 x<- 1+2  意思是把1+2的运算结果赋值给x，  赋值后，x会显示在右上角的框，Environment里的Value列表里     直接输入x 回车，就会把x的值（3）打印到控制台上,前面的那个[1]是结果的第一个，不用管他。

5.删除变量

a<-3
b <- 1
c <- 4
u <- 5+6
rm(b)
rm(u,c)  
rm(list = ls())#清空所有变量

代码可以复制，更推荐的方式是用键盘上q前面的那个tab键补齐。 看一下下面这个报错的原因：

ls（）
## Error: unexpected input in "ls?

括号是中文的。

7.列出历史命令

history() 相当于鼠标单击右上角的history标签

当你双击某个命令，他就会跳到你的控制台大于号后面了，可以修改后运行。

8.清空控制台

快捷键ctrl+l