生信马拉松 Day20 转录组 RNA-Seq-5

今天是转录组课程的最后一天，完结撒花✿✿ヽ(°▽°)ノ✿

主要关注的内容是基因组功能注释，即KEGG/GO/GSEA

基因需要转录为RNA和翻译为蛋白质才能发挥其功能

因此，所谓基因的功能实际上是基因产物的功能

功能注释是将生物学信息添加到基因或蛋白质序列的过程

基因功能无法实现软件预测，只能与数据库进行比对

因此，基因功能注释强烈依赖数据库

GO和KEGG相对GSEA/GSVA，没用到统计学模型，不需要显著性计算

GSEA & GSVA：以一组基因为单位，来描述是否参与某种功能，直接注释的结果是得到大量的功能节点

具有概念上的交叠现象，富集分析是从节点到网络的过程

是分析一组基因，和随机比较相比，在某个功能节点上是否过表达（over-presentation）

GSEA结果怎么看

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