前往小程序,Get更优阅读体验!
立即前往
首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布
社区首页 >专栏 >R学习 R包

R学习 R包

原创
作者头像
guacamole
修改2024-03-10 18:09:46
1510
修改2024-03-10 18:09:46
举报
文章被收录于专栏:生信学习笔记

R包

多个函数的打包存放

相应的R包可实现特定的分析功能

R包包含函数、数据、帮助文件、描述文件

安装

R包来源有CRAN、Bioconductor、GitHub

代码语言:{r}
复制
install.packages(tidyr)#CRAN
BiocManager::install("limma")#Bioconductor
devtools::install_github("jmzeng1314/idmap1")
library("tidyr")#加载
devtools::install_local(“xxxx.zip”)#本地安装

安装后每次使用都要先加载,也可用来检验是否成功安装 载入包时回答提示信息尽量no*

已经安装的包,可直接调用其中的函数

代码语言:{r}
复制
pheatmap::pheatmap(volcano)#包名::函数名
library(pheatmap)
pheatmap(volcano)

学习R包的使用

代码语言:{r}
复制
browseVignettes("limma") #作者一手教程,不是每个包都有
ls("package:limma")#列出包中的函数等

引用自生信技能树 小洁老师

原创声明:本文系作者授权腾讯云开发者社区发表,未经许可,不得转载。

如有侵权,请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除。

原创声明:本文系作者授权腾讯云开发者社区发表,未经许可,不得转载。

如有侵权,请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除。

评论
登录后参与评论
0 条评论
热度
最新
推荐阅读
目录
  • R包
    • 安装
      • 已经安装的包,可直接调用其中的函数
        • 学习R包的使用
        领券
        问题归档专栏文章快讯文章归档关键词归档开发者手册归档开发者手册 Section 归档