linux day2:文本查看、操作、统计命令

原创

不会写代码的医学生

修改于 2024-03-21 14:35:27

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cat: Concatenate 查看文本文件的内容，输出到屏幕

也可以写入内容和追加内容

常见参数:

常见用法

其他:

zcat:可以查看压缩的文本文件 tac:逆向查看

tips:

1.> 重定向

2.>> 追加，保持前面内容继续往下写

3.ctrl+c 终止

cat  readme.txt
cat  -n  readme.txt
## 写入文件
cat >file
Welcome to Biotrainee() !
^C            ## 这里是按Crtl  C
## 查看
cat file
Welcome to Biotrainee() !

head / tail -n :查看文件的前/后 n 行，默认 10 行

head  -n  20  Data/example.fq
## 查看 .bashrc 的最后 10 行
tail  ~/.bashrc
## 查看第20行
head  -n  20  Data/example.fq | tail -1

| 管道符前面的输出作为后面的输入

more:逐页查看，按空格翻页，按回车换行

按q退出

less 参数文件名常用参数-N:显示行号

-S:单行显示

zless:查看压缩文件

用“/keyword”进行关键词查询
n/N:上下浏览关键词
上下左右键查看文本内容 • Enter键向下移动一行 • 空格键翻页 • q键退出

less  Data/example.fq
less -S Data/example.fq
less -N Data/example.fq
zless -N Data/reads.1.fq.gz

wc:统计文本常见参数:

-l 统计行数

-w 统计字符串数 -c 统计字节数

cat -n readme.txt
cat readme.txt | wc 
wc -l readme.txt

cut:文本切割

常见参数:

-d 指定分隔符，默认\t;

-f 输出哪几列(字段fields)

less -S Data/example.gtf | cut -f 1,3-5
less -S Data/example.gtf | cut -d 'h' -f 1

cut –d不只可以指定标点符号为分隔符，也可指定字母或者数字等字符为分隔符

sort:排序

常见参数:

-n:按照数值从小到大进行排序 -V:字符串中含有数值时，按照数值从小到大排序 -r:逆向排序

-k:指定按哪一列排序

-t:指定分隔符

less -S Data/example.gtf | sort -k 4 | less -S
less -S Data/example.gtf | sort -n -k 4 | less -S

uniq:去除重复行

常见参数:

-c:统计每个字符串连续出现的行数

uniq比较”懒”，只能去除相邻的重复行! 因此记得要跟sort连用!

less -S Data/example.gtf | cut -f 3 | sort | uniq -c

paste:文本合并

常见参数: -d:指定分隔符 -s:按行合并常见用法:

paste file1 file2
seq 20 | paste - -

less -S Data/example.fq | paste - - - | less -S
paste file1 file2

tr:字符替换

常见用法:

tr ‘<pre>’ ‘<dest>’

常见参数:

-d:删除指定字符

-s:缩减连续重复字符

cat readme.txt | tr 'e' 'E'
cat readme.txt | tr '\n' '\t'
cat readme.txt | tr -d 'e'

原创声明：本文系作者授权腾讯云开发者社区发表，未经许可，不得转载。

如有侵权，请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除。

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