对于不经常编程的小伙伴,Genstat窗口的选择模型,方差分析、混合线性模型、配合力分析、基因与环境互作等功能,特别适合农业方向的数据分析。这个软件功能很强大,通过鼠标点击的形式就可以进行复杂模型的分析,非常666。
如何计算遗传力和配合力
Genstat优势功能
近来有老师咨询如何计算遗传力和配合力,那今天小编就通过沉浸式操作为大家展示一下Genstat软件的操作方法,及结果解读。
NCII试验介绍
在育种过程中,经常需要评价种质资源的遗传特性,引进自交系的好坏,确定自交系配合力的高低和利用的方式,经常用到的试验设计有完全双列杂交和不完全双列杂交。
不完全双列杂交是指把供试亲本按试验要求分为两组,只进行组间杂交,不进行组内杂交。
它相比完全双列杂交有以下优势:
1、从试验效率、资源消耗等方面考虑,在相同的试验规模和成本下,不完全双列杂交可以比完全双列杂交包括更多的亲本,获得更多的信息。
2、从育种实际考虑,有一些组合并非必要,按照育种目标分组,可以测用结合。
GenStat处理NCII数据的优势
常规处理方法
把亲本及其组合当成固定因子计算方差检验、配合力,把亲本及其组合当成随机因子计算方差组分和遗传力。
不足之处:这种计算方法(包括运用此方法的软件如Excel、DPS、SPSS等)不能处理缺失值(不平衡数据),而且不能定义多年多点数据的交互。
Genstat软件的优势
GenStat基于REML的混合线性模型可以解决缺失值及多年多点模型交互的情况,而且可以给出发表文章和实际育种中关注的所有参数,比如显著性、配合力、标准误及LSD等。
NCII主要分析结果介绍
方差分析表
关注重点:亲本和组合在不同性状方差分析的F值和显著性。
一般配合力和特殊配合力效应的显著性
关注重点:配合力效应值,和0比较时的LSD在0.05和0.01水平上的LSD值,确定显著性水平。
遗传参数评估
关注重点:不同性状的一般配合力和特殊配合力方差,不同性状的广义遗传力和狭义遗传力
Genstat分析NC II试验及结果解读
试验数据描述
现有五个外来引进的玉米自交系(A1-A5),用本地的四个常用自交系(B1-B4)对其进行配合力测定,设置3个区组得到产量数据。
分析模型路径
打开模型如下:Stat>>analysis of variance>>general
结果——方差分析表
一般配合力和特殊配合力效应值
03、均数的标准误和差数的标准误
遗传参数评估
模型:stats>>genetic model>>parental model
遗传参数结果——方差组分
一般配合力方差:foreign+native=36.256+15.448=51.704
特殊配合力方差组分:6.315
遗传参数——遗传力
广义遗传力:foreign+native+foreign.native=0.8672
狭义遗传力:foreign+native=0.7728
以上内容即为Genstat软件计算遗传力和配合力的方法,有任何疑问,欢迎留言。