前往小程序,Get更优阅读体验!
立即前往
首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布
社区首页 >专栏 >如何通过Genstat软件来计算遗传力和配合力?

如何通过Genstat软件来计算遗传力和配合力?

作者头像
邓飞
发布2024-03-25 09:36:49
730
发布2024-03-25 09:36:49
举报

对于不经常编程的小伙伴,Genstat窗口的选择模型,方差分析、混合线性模型、配合力分析、基因与环境互作等功能,特别适合农业方向的数据分析。这个软件功能很强大,通过鼠标点击的形式就可以进行复杂模型的分析,非常666。

如何计算遗传力和配合力

Genstat优势功能

近来有老师咨询如何计算遗传力和配合力,那今天小编就通过沉浸式操作为大家展示一下Genstat软件的操作方法,及结果解读。

NCII试验介绍

在育种过程中,经常需要评价种质资源的遗传特性,引进自交系的好坏,确定自交系配合力的高低和利用的方式,经常用到的试验设计有完全双列杂交和不完全双列杂交。

不完全双列杂交是指把供试亲本按试验要求分为两组,只进行组间杂交,不进行组内杂交。

它相比完全双列杂交有以下优势:

1、从试验效率、资源消耗等方面考虑,在相同的试验规模和成本下,不完全双列杂交可以比完全双列杂交包括更多的亲本,获得更多的信息。

2、从育种实际考虑,有一些组合并非必要,按照育种目标分组,可以测用结合。

GenStat处理NCII数据的优势

常规处理方法

把亲本及其组合当成固定因子计算方差检验、配合力,把亲本及其组合当成随机因子计算方差组分和遗传力。

不足之处:这种计算方法(包括运用此方法的软件如Excel、DPS、SPSS等)不能处理缺失值(不平衡数据),而且不能定义多年多点数据的交互。

Genstat软件的优势

GenStat基于REML的混合线性模型可以解决缺失值及多年多点模型交互的情况,而且可以给出发表文章和实际育种中关注的所有参数,比如显著性、配合力、标准误及LSD等。

NCII主要分析结果介绍

方差分析表

关注重点:亲本和组合在不同性状方差分析的F值和显著性。

一般配合力和特殊配合力效应的显著性

关注重点:配合力效应值,和0比较时的LSD在0.05和0.01水平上的LSD值,确定显著性水平。

遗传参数评估

关注重点:不同性状的一般配合力和特殊配合力方差,不同性状的广义遗传力和狭义遗传力

Genstat分析NC II试验及结果解读

试验数据描述

现有五个外来引进的玉米自交系(A1-A5),用本地的四个常用自交系(B1-B4)对其进行配合力测定,设置3个区组得到产量数据。

分析模型路径

打开模型如下:Stat>>analysis of variance>>general

结果——方差分析表

一般配合力和特殊配合力效应值

03、均数的标准误和差数的标准误

遗传参数评估

模型:stats>>genetic model>>parental model

遗传参数结果——方差组分

一般配合力方差:foreign+native=36.256+15.448=51.704

特殊配合力方差组分:6.315

遗传参数——遗传力

广义遗传力:foreign+native+foreign.native=0.8672

狭义遗传力:foreign+native=0.7728

以上内容即为Genstat软件计算遗传力和配合力的方法,有任何疑问,欢迎留言。

本文参与 腾讯云自媒体分享计划,分享自微信公众号。
原始发表:2024-03-18,如有侵权请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除

本文分享自 育种数据分析之放飞自我 微信公众号,前往查看

如有侵权,请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除。

本文参与 腾讯云自媒体分享计划  ,欢迎热爱写作的你一起参与!

评论
登录后参与评论
0 条评论
热度
最新
推荐阅读
领券
问题归档专栏文章快讯文章归档关键词归档开发者手册归档开发者手册 Section 归档