ZEBRA——单细胞水平的人和小鼠大脑的基因表达图谱

文章：Flotho, M., Amand, J., Hirsch, P., Grandke, F., Wyss-Coray, T., Keller, A., & Kern, F. (2024). ZEBRA: a hierarchically integrated gene expression atlas of the murine and human brain at single-cell resolution. Nucleic Acids Research, 52(D1), D1089-D1096. https://academic.oup.com/nar/article/52/D1/D1089/7369788

网站：https://www.ccb.uni-saarland.de/zebra

ZEBRA是一个大型的单细胞和单核RNA-seq数据库，它整合并标准化了 33 项研究的基因表达矩阵和metadata，涵盖了39 个大脑区域采样的 420 万个人类和小鼠脑细胞。它包含来自阿尔茨海默病、帕金森病和多发性硬化症等神经退行性疾病患者的样本，以及来自相关小鼠模型的样本。

各种数据集的说明：

所有的420万个细胞被拆分为两个较大的皮层数据集和两个较小的非皮层数据集，主要细胞类型是神经胶质细胞（绿色）、神经细胞（红色）和血管细胞（蓝色）。人类皮层数据集是第一个整合和提供几乎整个人类年龄段（即从幼儿期到成年晚期）的人脑细胞转录组的数据集。