DRMref——人类耐药机制参考数据库

文章：Liu, X., Yi, J., Li, T., Wen, J., Huang, K., Liu, J., ... & Zhou, X. (2024). DRMref: comprehensive reference map of drug resistance mechanisms in human cancer. Nucleic Acids Research, 52(D1), D1253-D1264. https://academic.oup.com/nar/article/52/D1/D1253/7438917

DRMref数据库是一个为研究癌症药物耐药机制而设计的综合性数据库，它利用单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据，对人类癌症中的耐药相关分子机制进行识别。该数据库包括来自30项研究的42个数据集，覆盖多种癌症类型、治疗方案和药物类型。DRMref提供了细胞组成、肿瘤内异质性、上皮-间质转化、细胞间互作以及耐药细胞中差异表达基因的详细注释和分析。

数据库的整体搭建思路如下：

该数据库深入探讨了特定的耐药机制，例如药物治疗靶点的异常和通过结构修改来失活药物。DRMref还提供了通路富集分析，并识别了与药物耐药相关的microRNA、motif和转录因子。其目的是为研究药物耐药性、药物组合治疗以及发现新的药物靶点提供宝贵资源。

DRMref的主要功能模块包括“搜索”和“浏览”。通过“搜索”功能，可以检索基因和药物，访问每个基因的详细注释页面和相关数据集。“浏览”功能支持浏览癌症类型、药物类型和功能分析，允许访问每个数据集的详细注释页面和药物耐药机制。所有的分析结果都可以下载，并通过热图、条形图、小提琴图、点图等直观的图表形式展示。