生信马拉松 Day25 TCGA生存分析

KM-plot注意：

1.离散型的临床信息直接画直接比

2.连续型的信息（如年龄、基因表达量、风险）分为2or3组分开画：根据中位数；根据某个具体的数值；最佳截断值

sfit <- survfit(Surv(time,event)~gender,data=meta)

建议使用时，不要修改分析代码里的time、event、meta这些列名、变量名，修改自己的数据和模板一致更不容易出错

sfit结果一般不看，就是直接放进下一步画图

这是个描述性统计分析，时非参数估计，对数据要求不高，直观地表现出两组或多组的生存率或死亡率，适合在文章中展示

event：0-活着，1-死了

time：自己知道的确定统一的单位

生存分析需要>200的样本量才适合

完结撒花！

生信技能树，生信马拉松，小洁老师