我们的数据可视化课程已经上线啦!!目前课程的主要方向是 科研、统计、地理相关的学术性图形绘制方法,后续也会增加商务插图、机器学等、数据分析等方面的课程。课程免费新增,这点绝对良心!
我们第一个数据可视化交流圈子也已经上线了,主要以我的第一本书籍《科研论文配图绘制指南-基于Python》为基础进行拓展,提供「课堂式」教学视频,还有更多拓展内容,可视化技巧远超书籍本身,书籍修正和新增都会分享到圈子里面~~
参与课程或者圈子的你将获取到:学员答疑、可视化资源分享、可视化技巧补充、可视化业务代做(学员和甲方对接)、副业交流、提升认知等等。
在准备我们的R语言数据可视化课程的拓展内容时,发现了很多有意思的可视化工具包~~
今天给大家介绍的可视化工具是-「ggPlantmap」,一个可以一键将图片对象转换成ggplot2绘图对象的好用工具,让数值映射变得超简单~~
ggPlantmap 是一个开源R软件包,目的是方便从植物图像生成信息丰富的ggplot绘图对象,以探索特定细胞类型的定量数据。ggPlantmap也可以结合外部定量数据,实现植物不同部位/细胞空间剖面的可视化显示。
可使用如下语法进行该工具的安装:
##install devtools (if you haven't already)
install.packages("devtools")
library(devtools)
## Installing from a github respository
install_github("leonardojo/ggPlantmap")
我们先看一下ggPlantmap工具的工作流程,可视化展示如下:
将外部定量数据叠加到 ggPlantmap 绘图对象中:
可视化绘制过程如下:
library(ggPlantmap)
ggPlantmap.plot(ggPm.At.earlyembryogenesis.devseries,Cell)
颜色数值映射可视化案例如下:
实际数据可视化案例(这些官网都提供了详细的教程代码,这里就直接给大姐列出绘图结果哈):
案例01
案例01
案例03
案例04
好了,更多关于ggPlantmap包的使用语法和可视化操纵案例,大家可参考ggPlantmap官网[1]
可视化学习圈子是书籍「科研论文配图绘制指南-基于Python」一书的学下圈子:主要通过以下几个方面,给大家带来比纸质书籍更丰富的学习内容:
「PS」:我们直播教学内容为课堂式教学,原作者带着大家对书籍一章、一节、一页的进行教学。而且直播的视频都会通过剪辑后整理成课程,圈子中的同学可以免费、反复观看。当然,新增内容和定期答疑,直播也是如此。
参考资料
[1]
ggPlantmap官网: https://github.com/leonardojo/ggPlantmap?tab=readme-ov-file。